203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1538 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1538  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 345 aa  714    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  36.5 
 
 		 434 aa  212  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0301  aldose 1-epimerase  34.68 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.545324  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0231  aldose 1-epimerase  33.72 
 
 		 341 aa  202  7e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  36.69 
 
 		 382 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  36.58 
 
 		 356 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  36.58 
 
 		 356 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  37.07 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  34.44 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  34.73 
 
 		 402 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  35.53 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  33.63 
 
 		 354 aa  189  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  32.94 
 
 		 387 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  32.4 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  32.4 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  34.66 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1368  aldose 1-epimerase  34.86 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00941348  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  35.52 
 
 		 347 aa  186  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  35 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  32.4 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  31.07 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  35.41 
 
 		 343 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  33.62 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  33.71 
 
 		 361 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1311  aldose 1-epimerase  31.61 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  32.29 
 
 		 355 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  32.07 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  31.78 
 
 		 348 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  33.91 
 
 		 362 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  33.91 
 
 		 362 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  34.73 
 
 		 384 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  33.91 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  34.88 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  30.92 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  31.77 
 
 		 438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  34.75 
 
 		 340 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  32.84 
 
 		 362 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  35.35 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  30.92 
 
 		 390 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  33.13 
 
 		 356 aa  172  9e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  31.41 
 
 		 397 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  33.63 
 
 		 390 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0996  aldose 1-epimerase  31.88 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  33.14 
 
 		 362 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  35.02 
 
 		 353 aa  169  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  32.56 
 
 		 368 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  31.7 
 
 		 356 aa  169  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  33.05 
 
 		 414 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  31.73 
 
 		 340 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  34.8 
 
 		 350 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  34.49 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  35.24 
 
 		 357 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  31.36 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  33.44 
 
 		 387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  32.29 
 
 		 362 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  32.34 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  31.34 
 
 		 376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  30.66 
 
 		 360 aa  162  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  30.77 
 
 		 400 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 319 aa  162  9e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  28.96 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  28.78 
 
 		 346 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  29.41 
 
 		 346 aa  159  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  30.88 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  29.12 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  29.29 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  32.15 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  31.74 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  29.3 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  30.32 
 
 		 347 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  30.68 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1851  Aldose 1-epimerase  31.16 
 
 		 335 aa  156  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0354  aldose 1-epimerase  30.12 
 
 		 343 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  32.06 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  31.33 
 
 		 351 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  28.65 
 
 		 357 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  30.82 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  29.15 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  29.29 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  30 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  29.71 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  30 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  32.69 
 
 		 354 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0236  aldose 1-epimerase  31.37 
 
 		 347 aa  150  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  31.67 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1515  Aldose 1-epimerase  30.35 
 
 		 355 aa  149  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  29.38 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  31.86 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  29.43 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  30.66 
 
 		 361 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  30 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  31.87 
 
 		 355 aa  146  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  30 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  28.05 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  30.34 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  29.28 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1593  aldose 1-epimerase  30.06 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  25.21 
 
 		 351 aa  139  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  27.92 
 
 		 406 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>