181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1368 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1368  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 348 aa  718    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00941348  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0301  aldose 1-epimerase  35.71 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.545324  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1538  aldose 1-epimerase  34.86 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 359 aa  186  8e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  32.58 
 
 		 347 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  35.09 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1311  aldose 1-epimerase  33.62 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0996  aldose 1-epimerase  34.1 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0231  aldose 1-epimerase  32.46 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  33.53 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  33.63 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  33.92 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  34.05 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  31.84 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1515  Aldose 1-epimerase  31.3 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  30.03 
 
 		 372 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  31.85 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  29.91 
 
 		 414 aa  155  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  28.94 
 
 		 362 aa  155  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  29.43 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  28.07 
 
 		 354 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  29.63 
 
 		 387 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  29.63 
 
 		 387 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  30.29 
 
 		 390 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  29.49 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  29.63 
 
 		 387 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  29.23 
 
 		 390 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  28.95 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  29.4 
 
 		 354 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  30.68 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  28.7 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  28.65 
 
 		 355 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  31.74 
 
 		 362 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  31.74 
 
 		 362 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  30.26 
 
 		 361 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  30.2 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  27.63 
 
 		 438 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  30.18 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  30.17 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  28.99 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  29.11 
 
 		 402 aa  146  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  29.86 
 
 		 392 aa  146  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  28.45 
 
 		 382 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  28.66 
 
 		 387 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  30.94 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  30.59 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  30.59 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  31.18 
 
 		 362 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  29.6 
 
 		 351 aa  142  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0354  aldose 1-epimerase  32 
 
 		 343 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  31.55 
 
 		 351 aa  142  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  31.38 
 
 		 356 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  29.91 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  31.88 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  30.81 
 
 		 356 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  30.81 
 
 		 356 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  28.94 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  31.38 
 
 		 356 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  29.6 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  30.75 
 
 		 351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  29.91 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  29.46 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  28.77 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  29.03 
 
 		 390 aa  139  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  30.09 
 
 		 351 aa  139  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  29.72 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  30.54 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  29.18 
 
 		 356 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  28.57 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  28.28 
 
 		 388 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  29.53 
 
 		 346 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1320  aldose 1-epimerase  30.46 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.249938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  27.84 
 
 		 340 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  29.53 
 
 		 346 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  29.24 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  31.61 
 
 		 353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  27.84 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  29.24 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  29.24 
 
 		 346 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  30 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  29.97 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  29.97 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  27.57 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  26.78 
 
 		 346 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  29.34 
 
 		 346 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  27.92 
 
 		 361 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  26.2 
 
 		 377 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  28.05 
 
 		 371 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  29.04 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  27.43 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  29.04 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  29.04 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  29.04 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  29.04 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  29.04 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  27.22 
 
 		 397 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  27.73 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  30.82 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  27.79 
 
 		 356 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  27.84 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>