180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1593 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1593  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 349 aa  721    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  32.66 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  35 
 
 		 340 aa  159  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  35.31 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  31.68 
 
 		 350 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  30.15 
 
 		 362 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1538  aldose 1-epimerase  30.06 
 
 		 345 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  29.46 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  30.49 
 
 		 362 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  30.82 
 
 		 362 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  31.37 
 
 		 434 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  29.06 
 
 		 351 aa  136  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  32.92 
 
 		 341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  30.81 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  30.65 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  30.65 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  29.97 
 
 		 362 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  29.97 
 
 		 362 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  29.97 
 
 		 362 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  30.72 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  30.07 
 
 		 376 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  30.51 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  28.48 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0354  aldose 1-epimerase  31.35 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  31.13 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1515  Aldose 1-epimerase  27.57 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  28.13 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  27.83 
 
 		 343 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3579  aldose 1-epimerase  27.83 
 
 		 343 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  27.89 
 
 		 380 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4021  aldose 1-epimerase  28.95 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000192131 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0413  aldose 1-epimerase  29.35 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  28.12 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  28.18 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  27.92 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  30.7 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0576  aldose 1-epimerase  29.57 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  30 
 
 		 351 aa  123  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  29.75 
 
 		 387 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0660  aldose 1-epimerase  28.66 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  29.45 
 
 		 387 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  28.21 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  29.45 
 
 		 387 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  29.05 
 
 		 438 aa  123  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0633  aldose 1-epimerase  28.66 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0656  Aldose 1-epimerase  28.66 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  30.65 
 
 		 355 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  28.98 
 
 		 341 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  27.38 
 
 		 397 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  28.13 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3272  aldose 1-epimerase  29.93 
 
 		 346 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0965292  hitchhiker  0.000248794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  29.1 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  27.9 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0996  aldose 1-epimerase  31 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  29.07 
 
 		 387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0301  aldose 1-epimerase  28.3 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.545324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  30.75 
 
 		 353 aa  119  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0651  aldose 1-epimerase  30.13 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  hitchhiker  0.000000283833 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1311  aldose 1-epimerase  30.65 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  27.27 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  28.7 
 
 		 375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  27.65 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  27.4 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1368  aldose 1-epimerase  30.19 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00941348  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  29.09 
 
 		 351 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  28.12 
 
 		 351 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  28.48 
 
 		 390 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  27.88 
 
 		 392 aa  115  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  28.4 
 
 		 388 aa  115  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  29.15 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  30.67 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  26.02 
 
 		 354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  26.58 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  27.12 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  28.01 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  28.18 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  28.15 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  27.52 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  25.89 
 
 		 351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  27.63 
 
 		 354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  29.22 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0231  aldose 1-epimerase  28.74 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  32.14 
 
 		 397 aa  113  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  27.65 
 
 		 360 aa  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  26.1 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  26.79 
 
 		 363 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  25.57 
 
 		 356 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  25.89 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  25.39 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  27.69 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  30.99 
 
 		 350 aa  109  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  28 
 
 		 385 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  26.45 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  26.45 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0030  aldose 1-epimerase  27.6 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  27.17 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  27.97 
 
 		 393 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  26.27 
 
 		 357 aa  106  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  27.79 
 
 		 402 aa  106  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  29.17 
 
 		 355 aa  105  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>