180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0301 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0301  aldose 1-epimerase  100 
 
 
340 aa  706    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.545324  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1311  aldose 1-epimerase  35.09 
 
 
331 aa  236  3e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0996  aldose 1-epimerase  36.69 
 
 
327 aa  230  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0231  aldose 1-epimerase  38.37 
 
 
341 aa  223  3e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1538  aldose 1-epimerase  34.68 
 
 
345 aa  208  9e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1368  aldose 1-epimerase  35.71 
 
 
348 aa  206  5e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00941348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  30.64 
 
 
350 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  30.72 
 
 
347 aa  176  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  30.06 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  31.02 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  28.08 
 
 
355 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  28.11 
 
 
434 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  28.14 
 
 
347 aa  153  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  30.43 
 
 
355 aa  153  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0354  aldose 1-epimerase  30.15 
 
 
343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  28.82 
 
 
359 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  30.36 
 
 
356 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  30.36 
 
 
356 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  27.07 
 
 
382 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  30.19 
 
 
351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0236  aldose 1-epimerase  29.81 
 
 
347 aa  146  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  30.21 
 
 
357 aa  146  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  29.49 
 
 
362 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  29.05 
 
 
343 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  27.12 
 
 
382 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  28.32 
 
 
350 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  29.38 
 
 
362 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  29.1 
 
 
362 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  29.1 
 
 
362 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  26.84 
 
 
382 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  27.22 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  30.91 
 
 
351 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  29.67 
 
 
384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  29.62 
 
 
351 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  27.35 
 
 
352 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  26.11 
 
 
348 aa  139  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  27.38 
 
 
387 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  28.15 
 
 
354 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  25.82 
 
 
348 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  26.84 
 
 
354 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  29.65 
 
 
362 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  29.36 
 
 
362 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  25.65 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  28.11 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  30.72 
 
 
340 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1515  Aldose 1-epimerase  28.98 
 
 
355 aa  136  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  27.74 
 
 
346 aa  136  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  29.73 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  29.3 
 
 
351 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  26.8 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  24.65 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  28.98 
 
 
351 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  28.27 
 
 
356 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  28.27 
 
 
356 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  26.21 
 
 
397 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  25.72 
 
 
360 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2245  aldose 1-epimerase  28.12 
 
 
339 aa  133  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  25.72 
 
 
360 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  25.21 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  26.72 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1170  aldose 1-epimerase  28.13 
 
 
350 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  25.96 
 
 
392 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  25.21 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  26.22 
 
 
317 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  25.81 
 
 
400 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  26.24 
 
 
351 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  26.24 
 
 
362 aa  129  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  26.15 
 
 
361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  26.96 
 
 
376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  24.78 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  24.28 
 
 
380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  27.4 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  25.86 
 
 
387 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  24.86 
 
 
346 aa  126  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  25.94 
 
 
351 aa  126  6e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  27.11 
 
 
336 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  26.35 
 
 
390 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  25.89 
 
 
346 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  25.68 
 
 
387 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  25.68 
 
 
387 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  26.13 
 
 
387 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  24.14 
 
 
346 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  29.79 
 
 
338 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  25.89 
 
 
346 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  27.11 
 
 
356 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  25.89 
 
 
346 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  25.89 
 
 
346 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.285804 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  26.19 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  26.19 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  25.78 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  26.19 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  26.19 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  26.19 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  26.19 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  25.68 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  25.89 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  26.19 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3655  aldose 1-epimerase  23.96 
 
 
413 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  25.45 
 
 
390 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  26.24 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>