178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0996 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0996  aldose 1-epimerase  100 
 
 
327 aa  670    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1311  aldose 1-epimerase  65.05 
 
 
331 aa  437  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0301  aldose 1-epimerase  36.69 
 
 
340 aa  230  3e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.545324  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1368  aldose 1-epimerase  34.1 
 
 
348 aa  172  5e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00941348  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0231  aldose 1-epimerase  31.96 
 
 
341 aa  170  3e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1538  aldose 1-epimerase  31.88 
 
 
345 aa  170  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  32.08 
 
 
350 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  29.94 
 
 
357 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  32.53 
 
 
348 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  29.41 
 
 
359 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  29.39 
 
 
383 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  29.02 
 
 
387 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  31.34 
 
 
347 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  30 
 
 
351 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  29.71 
 
 
382 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  29.49 
 
 
361 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  28.66 
 
 
355 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  26.86 
 
 
354 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  27.96 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  26.72 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  29.39 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  28.53 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  29.89 
 
 
362 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  28 
 
 
354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  27.56 
 
 
392 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0236  aldose 1-epimerase  29.71 
 
 
347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  30.27 
 
 
346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  27.43 
 
 
384 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  29.33 
 
 
414 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  30 
 
 
346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  29.97 
 
 
346 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  29.97 
 
 
346 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  30 
 
 
346 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  29.97 
 
 
346 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  29.97 
 
 
346 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  29.97 
 
 
346 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  29.97 
 
 
346 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  25.36 
 
 
434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  30 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  29.63 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  30.06 
 
 
346 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  29.6 
 
 
362 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  29.6 
 
 
362 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  26.59 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  29.71 
 
 
346 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  28.66 
 
 
352 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  27.03 
 
 
400 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  27.75 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  28.07 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  28.61 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  29.23 
 
 
360 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  27.35 
 
 
357 aa  125  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  28.77 
 
 
382 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  28.81 
 
 
350 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  27.91 
 
 
387 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0354  aldose 1-epimerase  28.27 
 
 
343 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  28.12 
 
 
376 aa  123  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  27.27 
 
 
356 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  27.27 
 
 
356 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  28.57 
 
 
355 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  29.02 
 
 
375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  28.62 
 
 
351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  28.53 
 
 
390 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  26.47 
 
 
351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  27.54 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1593  aldose 1-epimerase  31 
 
 
349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  28.74 
 
 
397 aa  119  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  27.43 
 
 
359 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  26.1 
 
 
340 aa  119  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  27.38 
 
 
362 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  28.03 
 
 
362 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  26.87 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  30.03 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  28.19 
 
 
346 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  27 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  29 
 
 
317 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  27.04 
 
 
362 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  27.68 
 
 
402 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  26.28 
 
 
347 aa  116  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  26.57 
 
 
384 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  26.5 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  26.69 
 
 
360 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  26.69 
 
 
360 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  25.74 
 
 
354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  27.06 
 
 
390 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  26.44 
 
 
393 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  28.7 
 
 
345 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  30.35 
 
 
356 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  26.5 
 
 
361 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  27.99 
 
 
357 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  26.88 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  26.88 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  26.76 
 
 
390 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  28.41 
 
 
388 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  25.72 
 
 
387 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  25.83 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  27.21 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  28.44 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  25.61 
 
 
351 aa  109  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  27.75 
 
 
387 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>