158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33650 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  100 
 
 		 318 aa  636    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  53.08 
 
 		 290 aa  287  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  45.79 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  42.14 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  42.19 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  42.09 
 
 		 303 aa  215  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  40.66 
 
 		 323 aa  208  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  40.74 
 
 		 302 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  41.18 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  40.47 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  42.11 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  39.53 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  40.07 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  40.67 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  39.26 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  40.67 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  40.26 
 
 		 307 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  40.86 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  38.16 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  37.92 
 
 		 294 aa  176  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  34.56 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  36.18 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  36.7 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  38.14 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  37.38 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  36.61 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  34.78 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  29.15 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  34.67 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  34.45 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  28.14 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  28.14 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  30.18 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  30.18 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  30.18 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  28.14 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  28.14 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  28.14 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  28.96 
 
 		 280 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  29.29 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  31.83 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  30.92 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  31.76 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  29.47 
 
 		 262 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  30.41 
 
 		 263 aa  97.4  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  26.07 
 
 		 312 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  30.4 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  25.46 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  27.52 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  26.82 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  28.06 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  26.17 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  36.36 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  24.66 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  28.24 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  27.3 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  29.5 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  27.34 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  26.75 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  26.91 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  27.38 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  23.92 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  27.45 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  25.59 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  26.04 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  28.26 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  23.87 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  25.08 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  26.62 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  24.68 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  24.68 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  24.68 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  24.68 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  24.68 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  25.17 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  21.54 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  23.68 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  29.34 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  24.5 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  25.55 
 
 		 293 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  22.6 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  22.73 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  26.4 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  27.35 
 
 		 300 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  19 
 
 		 290 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0638  aldose 1-epimerase  25.84 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  25.7 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  19 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  27.78 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  27.78 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  24.18 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  32 
 
 		 383 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  28.57 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  25.68 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3194  aldose 1-epimerase  34.94 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0888989 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0354  aldose 1-epimerase  27.27 
 
 		 343 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  24.5 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  24.18 
 
 		 296 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  25.45 
 
 		 356 aa  49.7  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  25.45 
 
 		 356 aa  49.7  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>