182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0149 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 336 aa  670    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  36.22 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  36.98 
 
 		 306 aa  153  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  32.56 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  29.22 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  29.22 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  26.71 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  29.32 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  28.62 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  29.32 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  29.55 
 
 		 302 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  29.03 
 
 		 309 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  31.3 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  29.76 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  31.68 
 
 		 301 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  29.21 
 
 		 294 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  30.53 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  32.71 
 
 		 311 aa  86.3  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  31.23 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  29.21 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  29.21 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  29.11 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  29.11 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  29.02 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  32.94 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  29.11 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  29.11 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  28.33 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  27.21 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  27.1 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  26.69 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  31.13 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  28.66 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  25.49 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  25.2 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  27.99 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  25.82 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  27.1 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  27.1 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  27.1 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  27.1 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  27.1 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  26.96 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  27.18 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  27.18 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  30.74 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  25.49 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  27.24 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  27.62 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  26.86 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  26.86 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  29.84 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  27.24 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  25.1 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  25.1 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  31 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  25.1 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  27.92 
 
 		 297 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  27.82 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  28.66 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  27.88 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  24.91 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  26.96 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  28.62 
 
 		 325 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  26.1 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  29.39 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  26.13 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  27.55 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  25.19 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  25.8 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  29.93 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  29.49 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  28.06 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  25.89 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  26.45 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  25.56 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  26.91 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  29.01 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  30.15 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  28.97 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  26.35 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  25.16 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  32.27 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  27.31 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  27.83 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  23.44 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  23.44 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  23.44 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  24.53 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  28.47 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  27.17 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  33.93 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  28.83 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  25.38 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  30.59 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  25.19 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  29.38 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  28.4 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  29.43 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  30.82 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>