155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0628 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  100 
 
 
282 aa  567  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  36.91 
 
 
299 aa  175  9e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  39.25 
 
 
382 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  36.79 
 
 
311 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  38.21 
 
 
353 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  38.21 
 
 
353 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  38.21 
 
 
353 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  34.84 
 
 
285 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  37.59 
 
 
309 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  36.05 
 
 
302 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  36.15 
 
 
310 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  37.5 
 
 
353 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  37.5 
 
 
353 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  38.08 
 
 
353 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  36.33 
 
 
353 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  37 
 
 
357 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  37.23 
 
 
357 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  37.23 
 
 
357 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  37.23 
 
 
357 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  37.23 
 
 
357 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  37.23 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  37.23 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  37.23 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  34.98 
 
 
294 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  34.32 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  34.32 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  34.32 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  34.32 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  34.32 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  34.32 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  34.63 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  33.58 
 
 
290 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  32.38 
 
 
353 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  33.81 
 
 
352 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  34.58 
 
 
323 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  33.58 
 
 
290 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  36.69 
 
 
296 aa  136  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  31.03 
 
 
293 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  32.97 
 
 
297 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  34.98 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  32.43 
 
 
295 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  31.23 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  34.68 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  35.95 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  32.14 
 
 
296 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  33.22 
 
 
311 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  33.89 
 
 
311 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  33.1 
 
 
293 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  31.93 
 
 
305 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  33.1 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  33.96 
 
 
295 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  32.21 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  31.58 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  30.9 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  30.56 
 
 
289 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  29.82 
 
 
289 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  32.64 
 
 
296 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  32.38 
 
 
296 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  32.52 
 
 
325 aa  90.5  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  28.66 
 
 
318 aa  89  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  28.33 
 
 
336 aa  84  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  29.18 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  31.17 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  28.91 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  29.51 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  30.88 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  26.01 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  29.84 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  23.7 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  27.92 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  34.62 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  31.72 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  30.48 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  25.38 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  26.81 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  27.42 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  24.71 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  24.5 
 
 
312 aa  65.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  34.42 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  24.33 
 
 
295 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  25.17 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  27.89 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  29.57 
 
 
323 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  23.99 
 
 
314 aa  62.4  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  25.99 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  27.56 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  27.56 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  27.56 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  27.56 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  25.09 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  23.64 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  26.94 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  26.94 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  23.02 
 
 
269 aa  60.1  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  24.05 
 
 
308 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  24.05 
 
 
308 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  24.05 
 
 
308 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  25.31 
 
 
300 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  24.73 
 
 
263 aa  58.9  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  22.9 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>