150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1015 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 311 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  91.53 
 
 		 311 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  70.3 
 
 		 323 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  44.75 
 
 		 308 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  36.12 
 
 		 311 aa  152  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  35.79 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  31.92 
 
 		 305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  33.9 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  32.66 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  32.55 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  34.1 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  33.11 
 
 		 353 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  33 
 
 		 353 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  33.11 
 
 		 353 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  33.11 
 
 		 353 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  33.22 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  31.67 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  34.09 
 
 		 353 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  32.66 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  33.22 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  31.42 
 
 		 352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  32.24 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  29.9 
 
 		 353 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  30.49 
 
 		 357 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  30.49 
 
 		 344 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  30.49 
 
 		 357 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  30.49 
 
 		 357 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  30.49 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  30.49 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  30.49 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  29.83 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  28.43 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  29.7 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  34.96 
 
 		 295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  30.42 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  30.42 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  30.42 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  30.42 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  30.42 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  29.14 
 
 		 357 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  28.39 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  30.1 
 
 		 290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  29.63 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  29.77 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  28.72 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  30.19 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  28.71 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  28.25 
 
 		 293 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  29.1 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  31.71 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  31.43 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  31.73 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  27.67 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  27.57 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  27.16 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  29.55 
 
 		 289 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  29.1 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  27.04 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  25.87 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  25.91 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  30.35 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  26.53 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  26.33 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  31.52 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  26.33 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  26.33 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  29.96 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  28.47 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  28.17 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  41.67 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  27.08 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  31.43 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  27.68 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  27.67 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  29.25 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  25 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  29.17 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  23.17 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  27.24 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  26.21 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  22.06 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  33.64 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  28.63 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  24.9 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  23.67 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  23.67 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  23.67 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  31.19 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  28.79 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  30.84 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  22.58 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  23.46 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  32.11 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  32.73 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  32.73 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  32.73 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  22.58 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  22.43 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  28.91 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  29.27 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>