260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2973 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  100 
 
 
303 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  67.79 
 
 
302 aa  404  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  66.01 
 
 
303 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  48.8 
 
 
305 aa  277  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  50.65 
 
 
307 aa  269  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  46 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  45.18 
 
 
301 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  42.67 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  43.52 
 
 
299 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  40.6 
 
 
327 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  38.75 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  38.68 
 
 
300 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  41.58 
 
 
303 aa  196  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  44.52 
 
 
290 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  40.21 
 
 
280 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  40.07 
 
 
318 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  40.59 
 
 
306 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  38.73 
 
 
301 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  41.46 
 
 
307 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  39.26 
 
 
308 aa  192  7e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  39.51 
 
 
280 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  38.93 
 
 
308 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  37.72 
 
 
299 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  37.63 
 
 
308 aa  188  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  37.63 
 
 
308 aa  188  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  42.14 
 
 
297 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  37.63 
 
 
308 aa  188  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  37.5 
 
 
295 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  37.5 
 
 
295 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  37.5 
 
 
295 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  39.39 
 
 
321 aa  186  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  38.72 
 
 
302 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  38.18 
 
 
311 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  34.78 
 
 
299 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  38.38 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  38 
 
 
293 aa  167  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  37.79 
 
 
323 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  38.91 
 
 
290 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  35.59 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  34.75 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  36.36 
 
 
323 aa  159  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  32.45 
 
 
318 aa  139  8.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  32.06 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  27.78 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  29.04 
 
 
345 aa  99.8  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  29.18 
 
 
316 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  25 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  29.01 
 
 
269 aa  87  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  29.11 
 
 
263 aa  86.7  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  24.13 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  29.15 
 
 
347 aa  82.4  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  27.37 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  29.82 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  27.3 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  25.38 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  26.72 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  29.43 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  30.63 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  28.57 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  27.48 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  28.12 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  28.12 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  29.32 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  29.12 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  29.17 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  27.44 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  28.41 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  30.15 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  31.03 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  30.07 
 
 
359 aa  68.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  25.66 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  28.93 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  26.16 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  29.1 
 
 
360 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  26.84 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  29.1 
 
 
360 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  29.24 
 
 
360 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  27.31 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  28.87 
 
 
361 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  25.82 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  28.11 
 
 
384 aa  65.9  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  27.85 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  28.11 
 
 
400 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  30.86 
 
 
346 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  26.32 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  28.4 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  23.48 
 
 
355 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  27.44 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  24.48 
 
 
356 aa  63.9  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2751  aldose 1-epimerase  28.52 
 
 
336 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  27 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  27.43 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  25.07 
 
 
375 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  27.78 
 
 
318 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  24.11 
 
 
393 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  29.71 
 
 
357 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  27.61 
 
 
371 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  27.21 
 
 
383 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  26.57 
 
 
384 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  33.87 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>