154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0270 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  100 
 
 		 291 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  97.59 
 
 		 291 aa  580  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  43.79 
 
 		 290 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  43.6 
 
 		 290 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  43.1 
 
 		 290 aa  259  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  43.1 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  43.1 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  43.1 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  43.1 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  43.1 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  42.56 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  42.91 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  42.41 
 
 		 290 aa  255  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  41.52 
 
 		 290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  42.96 
 
 		 287 aa  232  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  43.21 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  39.59 
 
 		 292 aa  225  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  39.93 
 
 		 289 aa  221  7e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  40.96 
 
 		 290 aa  218  8.999999999999998e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  40.48 
 
 		 288 aa  209  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  36.86 
 
 		 295 aa  203  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  39.38 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  39.36 
 
 		 288 aa  193  4e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  36.13 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  34.87 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1177  galactose mutarotase-like protein  35.84 
 
 		 292 aa  181  9.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D38  galactose mutarotase-like protein  33.33 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  31.62 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  32.36 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  33.78 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  34.12 
 
 		 292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  30.14 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  31.25 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  34.25 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  32.74 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  31.56 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  31.29 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1529  Aldose 1-epimerase  29.11 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  29.86 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  32.29 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  30.17 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  30.21 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  32.53 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1883  Aldose 1-epimerase  30.25 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  30.69 
 
 		 289 aa  152  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  28.03 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  28.93 
 
 		 291 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  31.66 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  33.21 
 
 		 293 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  29.58 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  32.72 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  32.41 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  30.28 
 
 		 305 aa  85.5  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  25.69 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  28.71 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  25.6 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  29.38 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  29.38 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  36.63 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  23.22 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  25.46 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  22.31 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  28.91 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  28.86 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  25.94 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  26.42 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  28.45 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  22.75 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  27.27 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  22.75 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  25.48 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  25.48 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  24.31 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  23.22 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  19.05 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  25.1 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  28.38 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5126  hypothetical protein  33.65 
 
 		 122 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  28.83 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  21.32 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  29.45 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  29.45 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  29.45 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  28 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  27.91 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  24.68 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  34.65 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  34.65 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  32.04 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  23.48 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  27.48 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  23.3 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  23.83 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  23.83 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  25.9 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  24.11 
 
 		 334 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  22.73 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  24.43 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85423  hypothetical uncharacterized conserved protein  29.03 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0569839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1848  putative aldose 1-epimerase  27.63 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.905542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>