90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_D38 on replicon NC_008506
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008506  LACR_D38  galactose mutarotase-like protein  100 
 
 
301 aa  618  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  57.38 
 
 
298 aa  371  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  35.71 
 
 
290 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  35.39 
 
 
290 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  35.1 
 
 
290 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  35.1 
 
 
290 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  35.06 
 
 
290 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  35.1 
 
 
290 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  35.1 
 
 
290 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  35.1 
 
 
290 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  35.39 
 
 
290 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  35.2 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  34.19 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  35.71 
 
 
287 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  34.92 
 
 
291 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  33.33 
 
 
291 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  34.24 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  35.93 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  36.01 
 
 
284 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  34.68 
 
 
288 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  32.77 
 
 
290 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  32.99 
 
 
290 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  32.78 
 
 
295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  31.31 
 
 
289 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  31.29 
 
 
313 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  32.88 
 
 
304 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  29.1 
 
 
289 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  31.25 
 
 
289 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  30.07 
 
 
297 aa  138  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  32.53 
 
 
286 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  27.24 
 
 
288 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  30.82 
 
 
292 aa  137  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  31.25 
 
 
291 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1177  galactose mutarotase-like protein  31.89 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  29.57 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  28.77 
 
 
292 aa  125  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  28.9 
 
 
292 aa  125  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  29.1 
 
 
295 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  28.38 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  30.39 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  32.37 
 
 
294 aa  119  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  27.15 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  29.53 
 
 
289 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  28.23 
 
 
298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  29.1 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  27.72 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  28.72 
 
 
293 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1883  Aldose 1-epimerase  28.81 
 
 
331 aa  99.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1529  Aldose 1-epimerase  22.64 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  27.94 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  25.19 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  25.19 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  27.86 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  27.03 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  25.1 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  27.43 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  26.24 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  27.24 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  23.18 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  22.92 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  22.3 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  25.73 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  22.02 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  24.53 
 
 
284 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  24.91 
 
 
284 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  23.36 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  23.44 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  25.1 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  23.67 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  23.75 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  24.58 
 
 
282 aa  53.5  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  24.24 
 
 
284 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  23.74 
 
 
282 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  24.08 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  23.17 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  23.17 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  24.55 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  23.6 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  25.9 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  25.1 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  25.1 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  22.46 
 
 
301 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  24.69 
 
 
298 aa  46.2  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  25.23 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  25.23 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5126  hypothetical protein  29.36 
 
 
122 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1587  hypothetical protein  25.41 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000393399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  24.28 
 
 
399 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17895  predicted protein  24.22 
 
 
342 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217165  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  30.67 
 
 
306 aa  42.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>