111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5996 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  100 
 
 
289 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  84.67 
 
 
288 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  63.41 
 
 
289 aa  360  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  43.38 
 
 
297 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  36.79 
 
 
291 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  34.16 
 
 
286 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  32.4 
 
 
291 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  38.2 
 
 
292 aa  176  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1883  Aldose 1-epimerase  35.97 
 
 
331 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  32.03 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  36.9 
 
 
292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  31.62 
 
 
291 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  35.09 
 
 
289 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  36.75 
 
 
292 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  32.52 
 
 
290 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  32.17 
 
 
290 aa  169  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  32.17 
 
 
290 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  32.17 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  31.82 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  31.82 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  31.82 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  31.82 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  31.82 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  31.23 
 
 
290 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  32.17 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  32.87 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  33.91 
 
 
292 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  34.41 
 
 
292 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  30.69 
 
 
287 aa  159  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  32.75 
 
 
290 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  35.23 
 
 
292 aa  155  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  28.77 
 
 
292 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  31.64 
 
 
288 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  29.17 
 
 
295 aa  149  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  29.35 
 
 
289 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  30.95 
 
 
289 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  32.75 
 
 
295 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  33.69 
 
 
291 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D38  galactose mutarotase-like protein  31.25 
 
 
301 aa  139  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  28.57 
 
 
294 aa  138  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1177  galactose mutarotase-like protein  30.24 
 
 
292 aa  133  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  28.38 
 
 
298 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  28.52 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  28.24 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  27.72 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  28.9 
 
 
298 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1529  Aldose 1-epimerase  30.1 
 
 
293 aa  122  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  24.83 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  24.25 
 
 
288 aa  112  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  26.01 
 
 
292 aa  96.3  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  28 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  29.55 
 
 
291 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  26.29 
 
 
305 aa  87  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  27.88 
 
 
276 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  27.68 
 
 
286 aa  86.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  27.13 
 
 
284 aa  85.9  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  28.07 
 
 
290 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  28.07 
 
 
290 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  31.84 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  28.31 
 
 
282 aa  79  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  32.48 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  30.71 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  22.6 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  27.19 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  23.04 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  23.04 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  22.6 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  28.31 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  22.78 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  29.92 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  27.14 
 
 
304 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  25.78 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  25.78 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5126  hypothetical protein  39.19 
 
 
122 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  28.08 
 
 
302 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  25.78 
 
 
303 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  26.17 
 
 
303 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  28.08 
 
 
371 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  32.08 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  27.74 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  25.12 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85423  hypothetical uncharacterized conserved protein  30.07 
 
 
302 aa  56.2  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0569839  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  29.85 
 
 
303 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  25.09 
 
 
320 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  26.07 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  24.91 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  28.76 
 
 
312 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  26.45 
 
 
399 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2838  Aldose 1-epimerase  28.67 
 
 
323 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0834033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  30.65 
 
 
312 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1297  hypothetical protein  27.05 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1848  putative aldose 1-epimerase  26.49 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.905542  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  22.69 
 
 
306 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  26.77 
 
 
314 aa  46.6  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17895  predicted protein  29.87 
 
 
342 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217165  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  33.33 
 
 
297 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 
352 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.169817 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10222  possible apospory-associated protein c (AFU_orthologue; AFUA_4G08880)  26.11 
 
 
315 aa  45.8  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000407893  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  27.1 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  27.85 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>