37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3568 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3568  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  670    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.398485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1361  hypothetical protein  88.69 
 
 		 328 aa  602  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2519  hypothetical protein  42.73 
 
 		 333 aa  285  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00503793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0735  hypothetical protein  39.08 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0102  Aldose 1-epimerase  32.46 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2081  hypothetical protein  27.3 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0611  hypothetical protein  26.81 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.260773  normal  0.0246617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4678  hypothetical protein  29.08 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00455816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1413  hypothetical protein  26.8 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.675515 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0550  hypothetical protein  24.22 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.148328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0341  hypothetical protein  26.64 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  23.79 
 
 		 717 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  26.11 
 
 		 709 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4195  hypothetical protein  24.23 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4231  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 1096 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4327  hypothetical protein  26.64 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02405  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1093 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753671  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3782  tetratricopeptide repeat protein  27.67 
 
 		 1124 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1119  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.67 
 
 		 1093 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02441  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1093 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1128  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 1093 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2834  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 1124 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2702  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 1124 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2702  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 1093 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  24.15 
 
 		 710 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1820  hypothetical protein  25 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00406664  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 1116 aa  49.7  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  29.38 
 
 		 290 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0427  hypothetical protein  32.65 
 
 		 122 aa  47  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0888  hypothetical protein  40.62 
 
 		 642 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.0581061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3594  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.54 
 
 		 1100 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29124  hitchhiker  0.0000227347 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6948  hypothetical protein  28.98 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  27.53 
 
 		 289 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5014  hypothetical protein  27.86 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4489  putative cytoplasmic protein  28.49 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3370  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1146 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707224  normal  0.946733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2298  hypothetical protein  25.86 
 
 		 366 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00541193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>