19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4489 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4489  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 355 aa  738    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6904  hypothetical protein  62.65 
 
 		 350 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6948  hypothetical protein  62.02 
 
 		 350 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1541  hypothetical protein  61.42 
 
 		 350 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6288  hypothetical protein  61.42 
 
 		 350 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.381063 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2298  hypothetical protein  55.43 
 
 		 366 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00541193  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4072  DeoX  53.39 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4017  DeoX  53.1 
 
 		 337 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4180  DeoX protein  52.8 
 
 		 337 aa  362  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4001  DeoX  53.1 
 
 		 337 aa  361  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.281599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4122  DeoX protein  52.8 
 
 		 337 aa  361  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2839  hypothetical protein  50.89 
 
 		 360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0751  hypothetical protein  46.91 
 
 		 337 aa  327  3e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3351  monosaccharide-transporting ATPase  48.55 
 
 		 364 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.268142 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3736  hypothetical protein  48.51 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294096  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3469  hypothetical protein  48.51 
 
 		 364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1633  hypothetical protein  27.06 
 
 		 280 aa  95.9  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  21.74 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3568  hypothetical protein  28.49 
 
 		 330 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.398485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>