20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1541 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6904  hypothetical protein  92.29 
 
 		 350 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1541  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  716    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6288  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  716    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.381063 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6948  hypothetical protein  97.71 
 
 		 350 aa  703    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4489  putative cytoplasmic protein  61.42 
 
 		 355 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4180  DeoX protein  53.51 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4017  DeoX  53.51 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2839  hypothetical protein  53.03 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4122  DeoX protein  53.51 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4072  DeoX  53.82 
 
 		 337 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4001  DeoX  53.22 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.281599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2298  hypothetical protein  55 
 
 		 366 aa  363  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00541193  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0751  hypothetical protein  45.88 
 
 		 337 aa  355  7.999999999999999e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3736  hypothetical protein  51.59 
 
 		 364 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294096  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3469  hypothetical protein  51.59 
 
 		 364 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3351  monosaccharide-transporting ATPase  50.72 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.268142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1633  hypothetical protein  27.57 
 
 		 280 aa  96.7  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  21.52 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  24.45 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1361  hypothetical protein  27.84 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>