23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6948 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6904  hypothetical protein  92.86 
 
 
350 aa  668    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1541  hypothetical protein  97.71 
 
 
350 aa  703    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6288  hypothetical protein  97.71 
 
 
350 aa  703    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.381063 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6948  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4489  putative cytoplasmic protein  62.02 
 
 
355 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4180  DeoX protein  54.09 
 
 
337 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4017  DeoX  54.09 
 
 
337 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4122  DeoX protein  54.09 
 
 
337 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2839  hypothetical protein  53.16 
 
 
360 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4072  DeoX  54.41 
 
 
337 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4001  DeoX  53.8 
 
 
337 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.281599  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2298  hypothetical protein  55.29 
 
 
366 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00541193  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0751  hypothetical protein  46.18 
 
 
337 aa  355  5.999999999999999e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3736  hypothetical protein  51.88 
 
 
364 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294096  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3469  hypothetical protein  51.58 
 
 
364 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3351  monosaccharide-transporting ATPase  51.3 
 
 
364 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1633  hypothetical protein  28.15 
 
 
280 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  23.75 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1361  hypothetical protein  28.94 
 
 
328 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  21.52 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3568  hypothetical protein  28.98 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.398485 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0052  hypothetical protein  23.06 
 
 
402 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  29.08 
 
 
308 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>