35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2111 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  861    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02460  hypothetical protein  45.04 
 
 		 405 aa  353  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384226  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3318  hypothetical protein  44.47 
 
 		 405 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0146561  normal  0.285956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3544  hypothetical protein  45.69 
 
 		 381 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17680  hypothetical protein  44.04 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2292  hypothetical protein  42.56 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0063  hypothetical protein  43.72 
 
 		 402 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.833866  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04863  hypothetical protein  39.73 
 
 		 402 aa  319  6e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0052  hypothetical protein  42.25 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0056  hypothetical protein  42.57 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0036  hypothetical protein  42.27 
 
 		 402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0420  hypothetical protein  40.15 
 
 		 402 aa  303  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0126  hypothetical protein  41.5 
 
 		 391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  36.52 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2228  hypothetical protein  27.5 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5750  hypothetical protein  23.58 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1603  hypothetical protein  25.07 
 
 		 376 aa  104  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260795  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0967  hypothetical protein  27.3 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0252662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0532  hypothetical protein  25.21 
 
 		 375 aa  99.8  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3170  hypothetical protein  26.65 
 
 		 365 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2640  hypothetical protein  24.23 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4678  hypothetical protein  25.8 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00455816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3717  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  0.31665 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2888  hypothetical protein  21.55 
 
 		 279 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3965  hypothetical protein  25.08 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00271264  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0076  hypothetical protein  29.7 
 
 		 109 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6904  hypothetical protein  22.82 
 
 		 350 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0102  Aldose 1-epimerase  20.23 
 
 		 356 aa  50.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6948  hypothetical protein  21.52 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6288  hypothetical protein  21.52 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.381063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1541  hypothetical protein  21.52 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2124  hypothetical protein  23.53 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2941  hypothetical protein  24.32 
 
 		 276 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1413  hypothetical protein  26.44 
 
 		 367 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.675515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2628  hypothetical protein  23.49 
 
 		 279 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>