17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1633 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1633  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  585  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4017  DeoX  33.33 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4001  DeoX  33.33 
 
 
337 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.281599  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4122  DeoX protein  33.04 
 
 
337 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4180  DeoX protein  33.63 
 
 
337 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4072  DeoX  33.63 
 
 
337 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0751  hypothetical protein  30.21 
 
 
337 aa  141  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6904  hypothetical protein  28.07 
 
 
350 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6948  hypothetical protein  28.15 
 
 
350 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1541  hypothetical protein  27.57 
 
 
350 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6288  hypothetical protein  27.57 
 
 
350 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.381063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4489  putative cytoplasmic protein  27.06 
 
 
355 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2839  hypothetical protein  27.11 
 
 
360 aa  93.2  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3469  hypothetical protein  25.15 
 
 
364 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3736  hypothetical protein  24.85 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294096  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2298  hypothetical protein  25 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00541193  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3351  monosaccharide-transporting ATPase  24.62 
 
 
364 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>