20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3736 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3736  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  733    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294096  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3351  monosaccharide-transporting ATPase  89.01 
 
 
364 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268142 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3469  hypothetical protein  98.9 
 
 
364 aa  724    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2298  hypothetical protein  60.24 
 
 
366 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00541193  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2839  hypothetical protein  54.57 
 
 
360 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6948  hypothetical protein  51.88 
 
 
350 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6904  hypothetical protein  51.3 
 
 
350 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6288  hypothetical protein  51.59 
 
 
350 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.381063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1541  hypothetical protein  51.59 
 
 
350 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4489  putative cytoplasmic protein  48.51 
 
 
355 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0751  hypothetical protein  39.71 
 
 
337 aa  279  6e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4122  DeoX protein  42.82 
 
 
337 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4072  DeoX  42.52 
 
 
337 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4017  DeoX  42.52 
 
 
337 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4180  DeoX protein  42.23 
 
 
337 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4001  DeoX  42.52 
 
 
337 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.281599  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1633  hypothetical protein  24.85 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2228  hypothetical protein  26.14 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0126  hypothetical protein  24.08 
 
 
391 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  22.13 
 
 
423 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>