30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2228 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2228  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  725    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0532  hypothetical protein  39.67 
 
 
375 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3170  hypothetical protein  34.55 
 
 
365 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5750  hypothetical protein  35.12 
 
 
392 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0967  hypothetical protein  36.42 
 
 
353 aa  185  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0252662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1603  hypothetical protein  32.63 
 
 
376 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260795  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0063  hypothetical protein  28.62 
 
 
402 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.833866  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2640  hypothetical protein  31.29 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0056  hypothetical protein  28 
 
 
402 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0052  hypothetical protein  28 
 
 
402 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0036  hypothetical protein  28 
 
 
402 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0420  hypothetical protein  26.57 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3717  hypothetical protein  33.13 
 
 
323 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  0.31665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  28.78 
 
 
395 aa  129  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  27.5 
 
 
423 aa  129  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3965  hypothetical protein  31.21 
 
 
332 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00271264  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02460  hypothetical protein  28.7 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384226  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3318  hypothetical protein  25 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0146561  normal  0.285956 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04863  hypothetical protein  26.79 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3544  hypothetical protein  25.31 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2292  hypothetical protein  24.15 
 
 
404 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128179  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17680  hypothetical protein  27.46 
 
 
404 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0126  hypothetical protein  26.1 
 
 
391 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2124  hypothetical protein  27.27 
 
 
309 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2941  hypothetical protein  28.1 
 
 
276 aa  63.5  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2888  hypothetical protein  26.1 
 
 
279 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0076  hypothetical protein  35.9 
 
 
109 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3469  hypothetical protein  25.71 
 
 
364 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3736  hypothetical protein  26.14 
 
 
364 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294096  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2628  hypothetical protein  25.2 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>