20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3469 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3736  hypothetical protein  98.9 
 
 		 364 aa  724    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294096  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3351  monosaccharide-transporting ATPase  88.19 
 
 		 364 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.268142 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3469  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  734    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2298  hypothetical protein  60.24 
 
 		 366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00541193  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2839  hypothetical protein  54.85 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6948  hypothetical protein  51.58 
 
 		 350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6904  hypothetical protein  51.3 
 
 		 350 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6288  hypothetical protein  51.59 
 
 		 350 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.381063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1541  hypothetical protein  51.59 
 
 		 350 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4489  putative cytoplasmic protein  48.51 
 
 		 355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0751  hypothetical protein  39.12 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4122  DeoX protein  42.65 
 
 		 337 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4017  DeoX  42.35 
 
 		 337 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4072  DeoX  42.35 
 
 		 337 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4180  DeoX protein  42.06 
 
 		 337 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4001  DeoX  42.35 
 
 		 337 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.281599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1633  hypothetical protein  25.15 
 
 		 280 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2228  hypothetical protein  25.71 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0063  hypothetical protein  26.63 
 
 		 402 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.833866  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0126  hypothetical protein  24.08 
 
 		 391 aa  42.7  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>