17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4180 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4180  DeoX protein  100 
 
 		 337 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4017  DeoX  98.81 
 
 		 337 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4001  DeoX  97.92 
 
 		 337 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.281599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4072  DeoX  98.22 
 
 		 337 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4122  DeoX protein  98.22 
 
 		 337 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0751  hypothetical protein  55.06 
 
 		 337 aa  431  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6948  hypothetical protein  54.09 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1541  hypothetical protein  53.51 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6288  hypothetical protein  53.51 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.381063 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6904  hypothetical protein  53.8 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4489  putative cytoplasmic protein  52.8 
 
 		 355 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2298  hypothetical protein  48.97 
 
 		 366 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00541193  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2839  hypothetical protein  46.43 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3351  monosaccharide-transporting ATPase  43.4 
 
 		 364 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.268142 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3736  hypothetical protein  42.23 
 
 		 364 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294096  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3469  hypothetical protein  42.06 
 
 		 364 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1633  hypothetical protein  33.63 
 
 		 280 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>