17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0751 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0751  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  710    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4017  DeoX  55.36 
 
 
337 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4122  DeoX protein  55.36 
 
 
337 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4001  DeoX  55.36 
 
 
337 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.281599  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4180  DeoX protein  55.06 
 
 
337 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4072  DeoX  55.06 
 
 
337 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6948  hypothetical protein  46.18 
 
 
350 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1541  hypothetical protein  45.88 
 
 
350 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6288  hypothetical protein  45.88 
 
 
350 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.381063 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6904  hypothetical protein  45.59 
 
 
350 aa  342  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4489  putative cytoplasmic protein  46.91 
 
 
355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2839  hypothetical protein  44.67 
 
 
360 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2298  hypothetical protein  44.28 
 
 
366 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00541193  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3736  hypothetical protein  39.71 
 
 
364 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294096  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3469  hypothetical protein  39.12 
 
 
364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3351  monosaccharide-transporting ATPase  38.87 
 
 
364 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1633  hypothetical protein  30.21 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>