30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0126 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0126  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  808    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02460  hypothetical protein  48.66 
 
 
405 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2292  hypothetical protein  48.39 
 
 
404 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128179  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3318  hypothetical protein  46.26 
 
 
405 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0146561  normal  0.285956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17680  hypothetical protein  47.58 
 
 
404 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3544  hypothetical protein  45.97 
 
 
381 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04863  hypothetical protein  48.17 
 
 
402 aa  353  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0063  hypothetical protein  44.27 
 
 
402 aa  352  8e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.833866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0056  hypothetical protein  44.27 
 
 
402 aa  348  9e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0036  hypothetical protein  43.75 
 
 
402 aa  345  6e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0052  hypothetical protein  43.23 
 
 
402 aa  342  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0420  hypothetical protein  44.01 
 
 
402 aa  341  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  41.5 
 
 
423 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  32.18 
 
 
395 aa  212  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2228  hypothetical protein  26.1 
 
 
354 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0967  hypothetical protein  24.93 
 
 
353 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0252662 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5750  hypothetical protein  25.34 
 
 
392 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3170  hypothetical protein  23.53 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0532  hypothetical protein  27.27 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2640  hypothetical protein  26.28 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1603  hypothetical protein  24.1 
 
 
376 aa  63.2  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3965  hypothetical protein  27 
 
 
332 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00271264  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0102  Aldose 1-epimerase  26 
 
 
356 aa  53.5  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2628  hypothetical protein  25.45 
 
 
279 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3717  hypothetical protein  21.73 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  0.31665 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2888  hypothetical protein  22.92 
 
 
279 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2941  hypothetical protein  24.8 
 
 
276 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3736  hypothetical protein  24.08 
 
 
364 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294096  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0076  hypothetical protein  25.77 
 
 
109 aa  43.9  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3469  hypothetical protein  24.08 
 
 
364 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>