36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1621 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  816    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  36.52 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17680  hypothetical protein  34.91 
 
 		 404 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3544  hypothetical protein  34.76 
 
 		 381 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3318  hypothetical protein  34.47 
 
 		 405 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0146561  normal  0.285956 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04863  hypothetical protein  35.08 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02460  hypothetical protein  35.31 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2292  hypothetical protein  34.47 
 
 		 404 aa  229  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0126  hypothetical protein  32.18 
 
 		 391 aa  212  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0056  hypothetical protein  34.96 
 
 		 402 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0420  hypothetical protein  35.14 
 
 		 402 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0063  hypothetical protein  34.47 
 
 		 402 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.833866  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0036  hypothetical protein  35.74 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0052  hypothetical protein  34.56 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2228  hypothetical protein  28.78 
 
 		 354 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5750  hypothetical protein  26.34 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3170  hypothetical protein  27.35 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3717  hypothetical protein  27.56 
 
 		 323 aa  94  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  0.31665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0532  hypothetical protein  26.06 
 
 		 375 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0967  hypothetical protein  26 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0252662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2640  hypothetical protein  25.84 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3965  hypothetical protein  28.43 
 
 		 332 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00271264  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1603  hypothetical protein  22.74 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260795  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2941  hypothetical protein  26.24 
 
 		 276 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2124  hypothetical protein  26.98 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2888  hypothetical protein  24.09 
 
 		 279 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6904  hypothetical protein  22.74 
 
 		 350 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6948  hypothetical protein  23.75 
 
 		 350 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2628  hypothetical protein  23.98 
 
 		 279 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6288  hypothetical protein  24.45 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.381063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1541  hypothetical protein  24.45 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0076  hypothetical protein  28.97 
 
 		 109 aa  47.4  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2298  hypothetical protein  22.5 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00541193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4489  putative cytoplasmic protein  21.74 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3241  hypothetical protein  23.56 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3351  monosaccharide-transporting ATPase  22.09 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.268142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>