40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1820 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1820  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00406664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0341  hypothetical protein  32.58 
 
 
294 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1413  hypothetical protein  33.08 
 
 
367 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.675515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0102  Aldose 1-epimerase  29.77 
 
 
356 aa  89.4  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4195  hypothetical protein  29.62 
 
 
336 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4678  hypothetical protein  27.98 
 
 
365 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00455816  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0550  hypothetical protein  25.88 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.148328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4327  hypothetical protein  27.19 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0735  hypothetical protein  24.68 
 
 
299 aa  55.8  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3568  hypothetical protein  25 
 
 
330 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.398485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  26.48 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  35.19 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  30.26 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1361  hypothetical protein  25.1 
 
 
328 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  29.76 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  21.55 
 
 
290 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  21.55 
 
 
290 aa  46.2  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  21.55 
 
 
290 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  21.83 
 
 
290 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  21.55 
 
 
290 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  21.55 
 
 
290 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  37.37 
 
 
289 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2519  hypothetical protein  23.28 
 
 
333 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00503793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0641  hypothetical protein  24.02 
 
 
385 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  28.19 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  21.83 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  28.74 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  24.07 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  24.77 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  25.74 
 
 
292 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  22.78 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  32.35 
 
 
353 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2081  hypothetical protein  22.75 
 
 
311 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  31.46 
 
 
297 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  30.36 
 
 
282 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0694  hypothetical protein  27.06 
 
 
327 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  33.96 
 
 
305 aa  42.7  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  48.78 
 
 
286 aa  42.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  24.3 
 
 
291 aa  42.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  26.77 
 
 
284 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>