17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1413 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1413  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  716    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.675515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0102  Aldose 1-epimerase  32.46 
 
 
356 aa  162  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4195  hypothetical protein  33.82 
 
 
336 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0550  hypothetical protein  27.91 
 
 
326 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.148328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4327  hypothetical protein  30.82 
 
 
327 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1820  hypothetical protein  33.08 
 
 
283 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00406664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1361  hypothetical protein  28.12 
 
 
328 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4678  hypothetical protein  29.66 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00455816  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0341  hypothetical protein  31.42 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3568  hypothetical protein  26.09 
 
 
330 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.398485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0641  hypothetical protein  28.09 
 
 
385 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0735  hypothetical protein  24.28 
 
 
299 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2519  hypothetical protein  24.52 
 
 
333 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00503793  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0532  hypothetical protein  26.72 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0694  hypothetical protein  29.51 
 
 
327 aa  46.6  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  24.78 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5750  hypothetical protein  24.55 
 
 
392 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>