41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0102 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0102  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 356 aa  723    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1413  hypothetical protein  32.46 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.675515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3568  hypothetical protein  32.46 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.398485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1361  hypothetical protein  32.46 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4678  hypothetical protein  31.36 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00455816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2519  hypothetical protein  31.18 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00503793  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4195  hypothetical protein  30.7 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0550  hypothetical protein  27.06 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.148328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0341  hypothetical protein  28.28 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1820  hypothetical protein  29.77 
 
 		 283 aa  89.4  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00406664  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0735  hypothetical protein  25.87 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0611  hypothetical protein  24.18 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.260773  normal  0.0246617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4327  hypothetical protein  27.7 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0056  hypothetical protein  24.21 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0063  hypothetical protein  24.21 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.833866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2081  hypothetical protein  23.15 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0641  hypothetical protein  25.38 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0052  hypothetical protein  22.87 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0036  hypothetical protein  22.58 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0126  hypothetical protein  26 
 
 		 391 aa  53.5  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0420  hypothetical protein  21.75 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  20.23 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02460  hypothetical protein  23.3 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2292  hypothetical protein  23.06 
 
 		 404 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3544  hypothetical protein  22.01 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5750  hypothetical protein  22.56 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3318  hypothetical protein  22.4 
 
 		 405 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0146561  normal  0.285956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0938  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1151 aa  46.2  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2702  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 1093 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3170  hypothetical protein  23.32 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1119  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.31 
 
 		 1093 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37170  tetratricopeptide repeat protein  29.75 
 
 		 1126 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.285738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2702  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 1124 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2834  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 1124 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02405  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1093 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753671  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1128  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 1093 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02441  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1093 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3370  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 1146 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707224  normal  0.946733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3782  tetratricopeptide repeat protein  23.31 
 
 		 1124 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4231  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 1096 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  26.03 
 
 		 290 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>