41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3155 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  100 
 
 		 717 aa  1473    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  48.83 
 
 		 709 aa  639    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  47.16 
 
 		 710 aa  638    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  46.48 
 
 		 891 aa  242  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3752  hypothetical protein  47.79 
 
 		 773 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  45.86 
 
 		 618 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2358  hypothetical protein  44.11 
 
 		 769 aa  220  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.916043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3121  hypothetical protein  43.35 
 
 		 792 aa  213  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  44.57 
 
 		 576 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  42.8 
 
 		 629 aa  206  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1576  peptidase domain-containing protein  39.26 
 
 		 760 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0935  peptidase domain-containing protein  39.92 
 
 		 758 aa  191  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  42.34 
 
 		 620 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3913  hypothetical protein  37.46 
 
 		 289 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3724  hypothetical protein  38.93 
 
 		 289 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  38.81 
 
 		 510 aa  166  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 1116 aa  98.2  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2702  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1093 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2702  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1124 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1119  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 1093 aa  97.8  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3782  tetratricopeptide repeat protein  29.41 
 
 		 1124 aa  97.4  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02405  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1093 aa  97.8  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753671  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2834  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1124 aa  97.4  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1128  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1093 aa  97.4  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02441  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1093 aa  97.8  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4231  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 1096 aa  88.2  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37170  tetratricopeptide repeat protein  24.56 
 
 		 1126 aa  87.8  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.285738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3370  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1146 aa  85.5  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707224  normal  0.946733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0123  Tetratricopeptide TPR_4  25.24 
 
 		 1106 aa  84  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3594  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.77 
 
 		 1100 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29124  hitchhiker  0.0000227347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0888  hypothetical protein  27.75 
 
 		 642 aa  78.2  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.0581061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0938  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1151 aa  75.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1713  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 		 1072 aa  73.9  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1361  hypothetical protein  25.91 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4112  Tetratricopeptide domain protein  21.43 
 
 		 1046 aa  67.4  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3568  hypothetical protein  23.79 
 
 		 330 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.398485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1342  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 668 aa  57.8  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.32152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0892  Tetratricopeptide TPR_4  25.37 
 
 		 667 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224705  normal  0.102157 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0735  hypothetical protein  24.52 
 
 		 299 aa  48.9  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  32.23 
 
 		 376 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2519  hypothetical protein  23.84 
 
 		 333 aa  43.9  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00503793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>