36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4112 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4112  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 1046 aa  2193    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1713  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 1072 aa  640    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3594  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.54 
 
 		 1100 aa  225  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29124  hitchhiker  0.0000227347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  22.25 
 
 		 1116 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3370  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 1146 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707224  normal  0.946733 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0938  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 		 1151 aa  151  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3782  tetratricopeptide repeat protein  21.9 
 
 		 1124 aa  145  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2834  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 1124 aa  144  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02441  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1093 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1128  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 1093 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0123  Tetratricopeptide TPR_4  21.15 
 
 		 1106 aa  143  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02405  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1093 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4231  TPR repeat-containing protein  21.87 
 
 		 1096 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2702  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 1124 aa  142  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2702  TPR repeat-containing protein  21.78 
 
 		 1093 aa  142  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37170  tetratricopeptide repeat protein  20.9 
 
 		 1126 aa  142  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.285738  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1119  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.16 
 
 		 1093 aa  141  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0888  hypothetical protein  22.7 
 
 		 642 aa  91.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.0581061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1342  TPR repeat-containing protein  21.18 
 
 		 668 aa  78.6  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.32152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0892  Tetratricopeptide TPR_4  22.74 
 
 		 667 aa  71.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224705  normal  0.102157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  21.43 
 
 		 717 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1676 aa  52.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  23.71 
 
 		 709 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.03 
 
 		 1154 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  24.38 
 
 		 710 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.03 
 
 		 624 aa  47.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.03 
 
 		 465 aa  47  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 3035 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 648 aa  46.2  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 3560 aa  46.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 402 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  20.94 
 
 		 810 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 935 aa  45.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.87 
 
 		 639 aa  44.7  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 468 aa  45.1  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  21.67 
 
 		 878 aa  44.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>