48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0123 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37170  tetratricopeptide repeat protein  48.23 
 
 		 1126 aa  842    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.285738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3594  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.64 
 
 		 1100 aa  641    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29124  hitchhiker  0.0000227347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 		 1116 aa  675    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0938  TPR repeat-containing protein  46.44 
 
 		 1151 aa  766    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0123  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 1106 aa  2206    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3370  TPR repeat-containing protein  43.92 
 
 		 1146 aa  746    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707224  normal  0.946733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4231  TPR repeat-containing protein  36.53 
 
 		 1096 aa  602  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02405  hypothetical protein  35.63 
 
 		 1093 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753671  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02441  hypothetical protein  35.63 
 
 		 1093 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1128  TPR repeat-containing protein  35.72 
 
 		 1093 aa  569  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2702  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 1124 aa  568  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1119  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.53 
 
 		 1093 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3782  tetratricopeptide repeat protein  35.49 
 
 		 1124 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2834  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 1124 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2702  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 		 1093 aa  562  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1713  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 1072 aa  211  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4112  Tetratricopeptide domain protein  21.62 
 
 		 1046 aa  168  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  28.4 
 
 		 709 aa  94.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  28.94 
 
 		 710 aa  93.2  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0888  hypothetical protein  26.8 
 
 		 642 aa  92.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.0581061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  25.36 
 
 		 717 aa  87.8  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1342  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 668 aa  66.6  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.32152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0892  Tetratricopeptide TPR_4  23.76 
 
 		 667 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224705  normal  0.102157 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.69 
 
 		 810 aa  58.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 		 878 aa  58.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 827 aa  57.4  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.12 
 
 		 927 aa  56.2  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2519  hypothetical protein  27.96 
 
 		 333 aa  55.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00503793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.43 
 
 		 1979 aa  55.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 		 4079 aa  50.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.81 
 
 		 352 aa  49.3  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  38.6 
 
 		 807 aa  48.9  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 1827 aa  47.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1138 aa  47  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 448 aa  46.2  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 713 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  35.09 
 
 		 792 aa  46.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.23 
 
 		 634 aa  46.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.71 
 
 		 2240 aa  46.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.88 
 
 		 286 aa  45.8  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 616 aa  45.8  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  25.91 
 
 		 586 aa  45.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 627 aa  45.4  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 290 aa  45.4  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.03 
 
 		 543 aa  45.4  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  29.02 
 
 		 395 aa  45.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.18 
 
 		 632 aa  44.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  27.27 
 
 		 349 aa  44.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>