24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0892 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0892  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 667 aa  1342    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224705  normal  0.102157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0888  hypothetical protein  49.18 
 
 		 642 aa  552  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.0581061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1342  TPR repeat-containing protein  42.83 
 
 		 668 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.32152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1713  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 1072 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4112  Tetratricopeptide domain protein  22.74 
 
 		 1046 aa  71.2  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4231  TPR repeat-containing protein  22.15 
 
 		 1096 aa  67.8  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0123  Tetratricopeptide TPR_4  24.09 
 
 		 1106 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0938  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 1151 aa  58.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1119  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.21 
 
 		 1093 aa  57.8  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02405  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1093 aa  57.8  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753671  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3782  tetratricopeptide repeat protein  23.68 
 
 		 1124 aa  57.8  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1128  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 1093 aa  57.8  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02441  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1093 aa  57.8  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2834  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 1124 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2702  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 1124 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2702  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 1093 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37170  tetratricopeptide repeat protein  22.48 
 
 		 1126 aa  55.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.285738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  25.37 
 
 		 717 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 		 1116 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3594  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.64 
 
 		 1100 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29124  hitchhiker  0.0000227347 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3370  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 		 1146 aa  47.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707224  normal  0.946733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  26.29 
 
 		 709 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  24.9 
 
 		 710 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 643 aa  44.3  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>