40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37170 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37170  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 1126 aa  2215    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.285738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3594  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37 
 
 		 1100 aa  686    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29124  hitchhiker  0.0000227347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  35.52 
 
 		 1116 aa  678    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0938  TPR repeat-containing protein  50.49 
 
 		 1151 aa  889    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0123  Tetratricopeptide TPR_4  48.59 
 
 		 1106 aa  844    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3370  TPR repeat-containing protein  44.63 
 
 		 1146 aa  793    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707224  normal  0.946733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4231  TPR repeat-containing protein  35.27 
 
 		 1096 aa  566  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1119  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.39 
 
 		 1093 aa  538  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2834  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 		 1124 aa  537  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3782  tetratricopeptide repeat protein  33.27 
 
 		 1124 aa  534  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02441  hypothetical protein  33.39 
 
 		 1093 aa  535  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2702  TPR repeat-containing protein  33.3 
 
 		 1124 aa  534  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02405  hypothetical protein  33.39 
 
 		 1093 aa  535  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753671  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1128  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 		 1093 aa  536  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2702  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 1093 aa  533  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1713  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 1072 aa  187  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4112  Tetratricopeptide domain protein  21.21 
 
 		 1046 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  24.94 
 
 		 717 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  28.61 
 
 		 710 aa  84.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  24.94 
 
 		 709 aa  73.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0888  hypothetical protein  22.37 
 
 		 642 aa  72.4  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.0581061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1342  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 668 aa  68.6  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.32152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.11 
 
 		 810 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 		 878 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0892  Tetratricopeptide TPR_4  22.48 
 
 		 667 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224705  normal  0.102157 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 605 aa  53.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 542 aa  47  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.73 
 
 		 632 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 3145 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 686 aa  47.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 611 aa  46.2  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.14 
 
 		 340 aa  46.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  26.38 
 
 		 1073 aa  46.6  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2519  hypothetical protein  26.01 
 
 		 333 aa  45.8  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00503793  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 685 aa  45.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.35 
 
 		 620 aa  45.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 635 aa  45.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 635 aa  45.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.6 
 
 		 359 aa  45.1  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 637 aa  45.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>