41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4351 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  47.16 
 
 		 717 aa  638    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  100 
 
 		 710 aa  1424    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  76.62 
 
 		 709 aa  1082    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  47.51 
 
 		 891 aa  238  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2358  hypothetical protein  48.72 
 
 		 769 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.916043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  45.79 
 
 		 618 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3121  hypothetical protein  46.35 
 
 		 792 aa  222  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  45.39 
 
 		 576 aa  218  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3752  hypothetical protein  47.15 
 
 		 773 aa  217  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3913  hypothetical protein  43.58 
 
 		 289 aa  209  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  44.68 
 
 		 629 aa  209  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3724  hypothetical protein  45.49 
 
 		 289 aa  207  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0935  peptidase domain-containing protein  43.4 
 
 		 758 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1576  peptidase domain-containing protein  43.77 
 
 		 760 aa  193  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  40.4 
 
 		 620 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  37.24 
 
 		 510 aa  162  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0123  Tetratricopeptide TPR_4  28.71 
 
 		 1106 aa  94  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3594  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.4 
 
 		 1100 aa  91.3  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29124  hitchhiker  0.0000227347 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0938  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 1151 aa  89.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4231  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 		 1096 aa  88.2  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37170  tetratricopeptide repeat protein  28.61 
 
 		 1126 aa  84.3  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.285738  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1119  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.43 
 
 		 1093 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02405  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1093 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753671  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02441  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1093 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2834  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1124 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3782  tetratricopeptide repeat protein  27.43 
 
 		 1124 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2702  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1093 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1128  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1093 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2702  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1124 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1342  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 668 aa  79.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.32152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 1116 aa  77.8  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3370  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1146 aa  76.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707224  normal  0.946733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0888  hypothetical protein  31.47 
 
 		 642 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.0581061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1713  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 1072 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3568  hypothetical protein  24.15 
 
 		 330 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.398485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1361  hypothetical protein  25.49 
 
 		 328 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  37.66 
 
 		 350 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4112  Tetratricopeptide domain protein  24.38 
 
 		 1046 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0892  Tetratricopeptide TPR_4  24.9 
 
 		 667 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224705  normal  0.102157 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2519  hypothetical protein  24.36 
 
 		 333 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00503793  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  29.87 
 
 		 480 aa  44.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>