19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0935 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0935  peptidase domain-containing protein  100 
 
 
758 aa  1533    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1576  peptidase domain-containing protein  84.36 
 
 
760 aa  1278    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599229  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2358  hypothetical protein  48.07 
 
 
769 aa  620  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.916043  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3121  hypothetical protein  52.4 
 
 
792 aa  619  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3752  hypothetical protein  44.33 
 
 
773 aa  496  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2975  peptidase domain protein  42.32 
 
 
484 aa  299  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000028196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  50.19 
 
 
891 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  45.17 
 
 
576 aa  239  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  45.52 
 
 
629 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  42.07 
 
 
620 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  40.83 
 
 
618 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  43.4 
 
 
710 aa  205  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  43.61 
 
 
709 aa  200  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3913  hypothetical protein  40.57 
 
 
289 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  39.92 
 
 
717 aa  191  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3724  hypothetical protein  40.67 
 
 
289 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  36.3 
 
 
510 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  34.15 
 
 
400 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  37.5 
 
 
281 aa  43.9  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>