More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0924 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  70.36 
 
 
629 aa  855    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 
618 aa  1256    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  48.12 
 
 
620 aa  569  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  49.26 
 
 
891 aa  240  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2358  hypothetical protein  47.37 
 
 
769 aa  233  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.916043  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3121  hypothetical protein  46.62 
 
 
792 aa  233  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  45.79 
 
 
710 aa  230  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3752  hypothetical protein  45.9 
 
 
773 aa  223  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  46.79 
 
 
709 aa  222  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  45.86 
 
 
717 aa  221  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  46.82 
 
 
576 aa  216  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0935  peptidase domain-containing protein  40.83 
 
 
758 aa  211  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1576  peptidase domain-containing protein  42.21 
 
 
760 aa  205  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599229  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3913  hypothetical protein  37.37 
 
 
289 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3724  hypothetical protein  39.7 
 
 
289 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 
510 aa  170  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  43.06 
 
 
567 aa  107  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  34.87 
 
 
427 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  38.8 
 
 
407 aa  107  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  38.25 
 
 
407 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  39.77 
 
 
572 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  33.86 
 
 
432 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  34.87 
 
 
435 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  39.35 
 
 
316 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  34.62 
 
 
292 aa  100  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  33.85 
 
 
450 aa  99.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  32.3 
 
 
429 aa  99  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal 
 
 
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.11 
 
 
430 aa  94.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  32.14 
 
 
444 aa  93.6  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  32.14 
 
 
444 aa  93.6  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  33.5 
 
 
443 aa  93.2  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  32.31 
 
 
461 aa  93.2  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  30.57 
 
 
445 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  33.33 
 
 
446 aa  92.8  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  37.86 
 
 
434 aa  92  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  37.86 
 
 
434 aa  92  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  31.63 
 
 
444 aa  91.3  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  40 
 
 
446 aa  91.3  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  32.32 
 
 
430 aa  90.5  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  40 
 
 
432 aa  89.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  29.74 
 
 
437 aa  90.1  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  37.78 
 
 
450 aa  89.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  35.61 
 
 
615 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  31.82 
 
 
430 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  41.48 
 
 
432 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  31.79 
 
 
461 aa  90.1  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.28 
 
 
446 aa  89.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  40.74 
 
 
432 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  33.33 
 
 
434 aa  88.6  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  31.63 
 
 
443 aa  88.6  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  32.32 
 
 
430 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  39.1 
 
 
451 aa  88.2  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  34.67 
 
 
434 aa  87.4  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  29.17 
 
 
354 aa  87  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  32.93 
 
 
442 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  37.59 
 
 
439 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  31.12 
 
 
443 aa  85.9  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  33.33 
 
 
442 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  29.95 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  34 
 
 
434 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  37.43 
 
 
298 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  39.01 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  33.55 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.82 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  34 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  31.12 
 
 
443 aa  84.7  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.37 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  35.17 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  36 
 
 
457 aa  84.7  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.79 
 
 
446 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.79 
 
 
446 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  33.11 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  33.11 
 
 
442 aa  84  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  36.73 
 
 
432 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  33.11 
 
 
442 aa  84  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  30.81 
 
 
403 aa  84  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  33.11 
 
 
442 aa  84  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  36.09 
 
 
451 aa  84  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  33.33 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  33.33 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  33.33 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  38.81 
 
 
646 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.82 
 
 
442 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  30.26 
 
 
429 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  37.59 
 
 
439 aa  83.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  32.89 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.03 
 
 
450 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.35 
 
 
445 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  29.65 
 
 
445 aa  82.8  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  30.3 
 
 
436 aa  82.8  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  36.64 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  31.69 
 
 
454 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.39 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  29.74 
 
 
436 aa  82  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  26.67 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  33.33 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  36.55 
 
 
428 aa  81.6  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  31.71 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  32.81 
 
 
442 aa  81.3  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  34.81 
 
 
440 aa  81.3  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>