23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1576 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0935  peptidase domain-containing protein  84.36 
 
 		 758 aa  1269    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1576  peptidase domain-containing protein  100 
 
 		 760 aa  1539    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2358  hypothetical protein  47.89 
 
 		 769 aa  624  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.916043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3121  hypothetical protein  51.66 
 
 		 792 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3752  hypothetical protein  37.12 
 
 		 773 aa  491  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2975  peptidase domain protein  42.42 
 
 		 484 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000028196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  50.56 
 
 		 891 aa  243  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  40.51 
 
 		 576 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  42.21 
 
 		 618 aa  217  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  45.9 
 
 		 629 aa  216  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  44.91 
 
 		 709 aa  209  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  43.77 
 
 		 710 aa  206  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  41.38 
 
 		 620 aa  203  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3724  hypothetical protein  43.51 
 
 		 289 aa  200  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3913  hypothetical protein  42.25 
 
 		 289 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  40.23 
 
 		 717 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 		 510 aa  154  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  36.96 
 
 		 400 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.71 
 
 		 689 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34 
 
 		 688 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  35.79 
 
 		 281 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  34.69 
 
 		 492 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  35.48 
 
 		 421 aa  43.9  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>