16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3724 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3724  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  584  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3913  hypothetical protein  92.39 
 
 		 289 aa  548  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  49.63 
 
 		 891 aa  238  8e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  46.04 
 
 		 709 aa  215  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  44.44 
 
 		 710 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  42.75 
 
 		 576 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2358  hypothetical protein  42.8 
 
 		 769 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.916043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1576  peptidase domain-containing protein  42.5 
 
 		 760 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3121  hypothetical protein  41.89 
 
 		 792 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0935  peptidase domain-containing protein  39.79 
 
 		 758 aa  195  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3752  hypothetical protein  42.97 
 
 		 773 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  38.05 
 
 		 618 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  38.49 
 
 		 717 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  37.34 
 
 		 620 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  38.03 
 
 		 629 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  33.56 
 
 		 510 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>