More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1054 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 352 aa  717    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.48 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 878 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 543 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29 
 
 		 1694 aa  116  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 927 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.94 
 
 		 632 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 562 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.48 
 
 		 988 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.1 
 
 		 784 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.9 
 
 		 373 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.39 
 
 		 745 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 649 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.39 
 
 		 462 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.69 
 
 		 818 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.92 
 
 		 810 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 1276 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.12 
 
 		 1022 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 617 aa  103  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.55 
 
 		 1056 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.1 
 
 		 1056 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  27.62 
 
 		 573 aa  99.4  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.84 
 
 		 1979 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 436 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 4079 aa  98.2  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 523 aa  96.7  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  28.57 
 
 		 706 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  26.69 
 
 		 572 aa  95.9  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 1094 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.21 
 
 		 397 aa  93.6  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 589 aa  93.6  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 4489 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.08 
 
 		 2240 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.1 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 718 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  25.42 
 
 		 750 aa  90.5  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.55 
 
 		 576 aa  90.5  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 605 aa  90.1  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1069 aa  89.7  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  27.24 
 
 		 314 aa  89.7  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1138 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 3035 aa  89.7  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  28.86 
 
 		 708 aa  89  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1421 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 715 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 711 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 662 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 371 aa  87.4  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  29.52 
 
 		 706 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 505 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 414 aa  87  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 955 aa  86.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 909 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 1737 aa  86.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.08 
 
 		 738 aa  86.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  28.97 
 
 		 295 aa  86.3  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.45 
 
 		 816 aa  85.9  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 3560 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  28.97 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.57 
 
 		 542 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1676 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 3145 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  28.26 
 
 		 612 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 602 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 685 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.92 
 
 		 689 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 602 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 594 aa  82.8  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 827 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.77 
 
 		 603 aa  82.8  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 681 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 		 750 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7350  hypothetical protein  30.13 
 
 		 668 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.63 
 
 		 620 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.54 
 
 		 237 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.76 
 
 		 784 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.74 
 
 		 875 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1121 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  27.43 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 750 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 615 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.01 
 
 		 733 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.24 
 
 		 626 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.09 
 
 		 839 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>