More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2851 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  57.62 
 
 		 866 aa  932    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  70.76 
 
 		 792 aa  1114    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  100 
 
 		 807 aa  1615    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3412  diguanylate cyclase with TPR repeats  37.65 
 
 		 816 aa  501  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2188  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.54 
 
 		 801 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1730  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  48.7 
 
 		 974 aa  334  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000283057  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 878 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.76 
 
 		 810 aa  77.8  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 221 aa  75.5  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 505 aa  70.5  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1406 aa  70.5  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  28.77 
 
 		 272 aa  70.5  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 280 aa  70.5  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 792 aa  70.5  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.52 
 
 		 624 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0825  diguanylate cyclase  26.17 
 
 		 594 aa  66.6  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 762 aa  66.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1276 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.26 
 
 		 2401 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 827 aa  65.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  22.52 
 
 		 1073 aa  65.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 718 aa  65.1  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.95 
 
 		 632 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.12 
 
 		 795 aa  65.1  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0486  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 965 aa  64.7  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.09 
 
 		 622 aa  64.7  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 435 aa  64.3  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 602 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 808 aa  63.9  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 697 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 1069 aa  62.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.64 
 
 		 816 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.09 
 
 		 620 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3476  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 634 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  0.161614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 466 aa  63.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  30.25 
 
 		 725 aa  62.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.92 
 
 		 695 aa  62.4  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  26.09 
 
 		 614 aa  62.4  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 715 aa  62.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.59 
 
 		 626 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.59 
 
 		 614 aa  62  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 614 aa  62  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 934 aa  62  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 374 aa  62  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.19 
 
 		 466 aa  62  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.59 
 
 		 614 aa  62  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.24 
 
 		 277 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.59 
 
 		 626 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 927 aa  61.2  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 612 aa  60.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0551  TPR domain-containing protein  30.3 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475712  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 523 aa  60.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.81 
 
 		 416 aa  60.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  30.17 
 
 		 395 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 620 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 366 aa  60.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2243  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 311 aa  60.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6122  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.29 
 
 		 3145 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  26.13 
 
 		 577 aa  59.7  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 681 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 362 aa  60.1  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 		 583 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 637 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.07 
 
 		 730 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  27.32 
 
 		 936 aa  60.1  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  25.59 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  26.13 
 
 		 577 aa  58.9  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.18 
 
 		 626 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 1450 aa  59.3  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.81 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 637 aa  58.9  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.56 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1955  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0490064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.64 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 739 aa  58.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.81 
 
 		 1764 aa  58.5  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  23.6 
 
 		 764 aa  58.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.47 
 
 		 1022 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29.13 
 
 		 714 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 935 aa  58.2  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 4489 aa  58.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 789 aa  57.8  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  29.71 
 
 		 1077 aa  57.8  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0602  RNA polymerase alpha subunit domain protein  33.33 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125598  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  26.86 
 
 		 538 aa  57.4  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 909 aa  57.4  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  26.73 
 
 		 475 aa  57.4  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 265 aa  57.4  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.71 
 
 		 882 aa  57.4  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 700 aa  57.4  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 1127 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>