265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0357 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0357  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 273 aa  558  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2283  TPR repeat-containing protein  67.57 
 
 		 186 aa  258  7e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.976866 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2664  TPR repeat-containing protein  65.95 
 
 		 187 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3025  TPR repeat-containing protein  57.3 
 
 		 185 aa  221  9e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0759  TPR repeat-containing protein  56.76 
 
 		 187 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.56 
 
 		 2401 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.68 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  29.31 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.54 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.92 
 
 		 837 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  27.96 
 
 		 1073 aa  59.7  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 593 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.99 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 566 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 878 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  32.19 
 
 		 475 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 1096 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 750 aa  56.6  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.45 
 
 		 795 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1116 aa  56.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.16 
 
 		 810 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.59 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 934 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 866 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  32.09 
 
 		 690 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.33 
 
 		 3301 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 		 3172 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  23.5 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 2240 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  24 
 
 		 550 aa  53.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 643 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 643 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.37 
 
 		 887 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 615 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  25.19 
 
 		 614 aa  52.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 602 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 690 aa  52.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 1252 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.25 
 
 		 624 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 1252 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 542 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1676 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  26.51 
 
 		 272 aa  52.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 465 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2421  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.84 
 
 		 199 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1178 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.76 
 
 		 572 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 581 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  24.24 
 
 		 682 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 3035 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 808 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.72 
 
 		 572 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.78 
 
 		 882 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 		 847 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.58 
 
 		 632 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.89 
 
 		 645 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  26.62 
 
 		 573 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 486 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 594 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1303  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.2 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 884 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.38 
 
 		 647 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  26.19 
 
 		 561 aa  50.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 942 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 505 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 351 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0559  O-antigen polymerase  34.07 
 
 		 647 aa  49.7  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.024189  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 3145 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  25.44 
 
 		 456 aa  49.3  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.82 
 
 		 594 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.28 
 
 		 557 aa  49.3  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 927 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 		 875 aa  49.3  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.14 
 
 		 286 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 357 aa  48.9  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 718 aa  48.9  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 860 aa  48.9  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 352 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.28 
 
 		 917 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  26.67 
 
 		 762 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 620 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  23.37 
 
 		 620 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 573 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1005 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 		 409 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.4 
 
 		 597 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 366 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.67 
 
 		 762 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 766 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 611 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 		 1056 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.4 
 
 		 561 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 605 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25 
 
 		 725 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>