More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0912 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0912  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 452 aa  921    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.160059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  35.46 
 
 		 566 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15961  predicted protein  34.09 
 
 		 1080 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88314  predicted protein  30.11 
 
 		 542 aa  80.5  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.333395  normal  0.0216247 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17184  predicted protein  26.62 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51802  predicted protein  28.16 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1024  Methyltransferase type 12  24.5 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31784 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  35 
 
 		 623 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 202 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  30.49 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0913  methyltransferase small  29.94 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 3035 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 878 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 3560 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10526  RmtA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5VLE3]  26.69 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.0936655 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 543 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  34.45 
 
 		 1138 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.52 
 
 		 810 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 662 aa  67  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 4489 aa  65.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 927 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 		 1252 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03520  protein arginine n-methyltransferase, putative  30 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0885983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 718 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 		 1252 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35268  predicted protein  30.66 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0796669  normal  0.0661795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.39 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.26 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 968 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.34 
 
 		 1056 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1094 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 		 689 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 589 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 1069 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1069  methyltransferase small  26.28 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0704702  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0135  putative RNA methylase  26.92 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 670 aa  60.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03096  Protein methyltransferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5VK73]  27.98 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.013321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 2240 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 523 aa  60.1  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 1276 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  31.78 
 
 		 191 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 269 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  27.08 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0848  putative RNA methylase  26.28 
 
 		 260 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.231779  normal  0.0319952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 639 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49245  predicted protein  22.55 
 
 		 717 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 654 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1807  putative RNA methylase  25.64 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4422  TPR repeat-containing protein  38 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  30.22 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.66 
 
 		 620 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  32.17 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.19 
 
 		 1022 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 597 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 711 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  33.61 
 
 		 550 aa  57.4  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.81 
 
 		 1979 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 808 aa  57  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 221 aa  57  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  37.36 
 
 		 745 aa  57  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 620 aa  57  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3123  ribosomal protein L11 methylase-like protein  32.33 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.835612  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 955 aa  56.6  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2196  hypothetical protein  26.28 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109141  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02290  arginine N-methyltransferase 3, putative  27.12 
 
 		 596 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.71 
 
 		 610 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 637 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 4079 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 374 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.31 
 
 		 988 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.48 
 
 		 818 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 732 aa  56.6  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25 
 
 		 816 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 279 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  38.96 
 
 		 213 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 700 aa  55.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2764  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 683 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762539  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  25.54 
 
 		 780 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  28.57 
 
 		 582 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  24.65 
 
 		 462 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.62 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.4 
 
 		 1056 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  27.86 
 
 		 594 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.13 
 
 		 784 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 714 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 3145 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.98 
 
 		 626 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  21.58 
 
 		 739 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.07 
 
 		 626 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  30.13 
 
 		 321 aa  54.3  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 471 aa  53.9  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 591 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>