85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17184 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_17184  predicted protein  100 
 
 
445 aa  924    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10526  RmtA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5VLE3]  61.46 
 
 
345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.0936655 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03520  protein arginine n-methyltransferase, putative  57.1 
 
 
342 aa  398  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0885983  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51802  predicted protein  53.42 
 
 
340 aa  348  1e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02290  arginine N-methyltransferase 3, putative  38.89 
 
 
596 aa  259  7e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03096  Protein methyltransferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5VK73]  39.94 
 
 
542 aa  253  6e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.013321  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  42.12 
 
 
270 aa  203  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35268  predicted protein  35 
 
 
394 aa  195  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0796669  normal  0.0661795 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54710  predicted protein  32.76 
 
 
410 aa  170  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0960644  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06620  protein-arginine N-methyltransferase, putative  32.36 
 
 
480 aa  147  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.129536  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1024  Methyltransferase type 12  27.7 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0805  Histone-arginine N-methyltransferase  29.78 
 
 
345 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2196  hypothetical protein  27.6 
 
 
297 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109141  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3123  ribosomal protein L11 methylase-like protein  27.84 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.835612  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0912  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.62 
 
 
452 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.160059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  28.71 
 
 
566 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15961  predicted protein  29.84 
 
 
1080 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3276  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.57 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.19 
 
 
315 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  33.07 
 
 
276 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  40.51 
 
 
292 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1807  putative RNA methylase  30.66 
 
 
260 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.95 
 
 
316 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  47.46 
 
 
318 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.47 
 
 
293 aa  50.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  45 
 
 
289 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0848  putative RNA methylase  30.22 
 
 
260 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.231779  normal  0.0319952 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  45 
 
 
289 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3738  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
312 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2724  hypothetical protein  26.76 
 
 
267 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  26.12 
 
 
249 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0925  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.99 
 
 
311 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.77 
 
 
313 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0135  putative RNA methylase  31.43 
 
 
264 aa  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1926  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.04 
 
 
306 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
308 aa  47.4  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17811  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.62 
 
 
311 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.578713  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00196  biotin synthesis protein  31.43 
 
 
232 aa  47  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.505545  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
250 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2027  putative methyltransferase  25.98 
 
 
330 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1069  methyltransferase small  29.2 
 
 
260 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0704702  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.17 
 
 
308 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.65 
 
 
300 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  37.78 
 
 
243 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  35 
 
 
313 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3791  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.45 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.220237 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  35 
 
 
313 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
242 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.29 
 
 
308 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
243 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1500  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.14 
 
 
299 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  25.75 
 
 
464 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  42.86 
 
 
258 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  46.67 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
210 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15391  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.97 
 
 
303 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  27.66 
 
 
260 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0608  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.65 
 
 
294 aa  45.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217984  hitchhiker  0.0000000198415 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.25 
 
 
316 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.01 
 
 
315 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.46 
 
 
296 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  38.75 
 
 
248 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2578  methyltransferase  29.86 
 
 
330 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000179081  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0315  hypothetical protein  26.21 
 
 
223 aa  44.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.59 
 
 
307 aa  44.3  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174777  unclonable  0.000000000413669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 
226 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.38 
 
 
242 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.62 
 
 
250 aa  43.9  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 
269 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
300 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  23.46 
 
 
234 aa  43.9  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1609  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 
156 aa  43.5  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.682504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 
246 aa  43.5  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  26.86 
 
 
207 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1569  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.78 
 
 
278 aa  43.5  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.641228  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  53.12 
 
 
311 aa  43.5  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  51.35 
 
 
264 aa  43.5  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.85 
 
 
244 aa  43.1  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1895  putative methyltransferase  28.36 
 
 
330 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.175832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  31.09 
 
 
285 aa  43.1  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15541  ribosomal protein L11 methyltransferase  53.66 
 
 
303 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.730327  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 
254 aa  43.1  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1950  putative methyltransferase  28.36 
 
 
330 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2083  putative methyltransferase  28.36 
 
 
330 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.018552  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2436  methyltransferase, putative  28.36 
 
 
330 aa  43.1  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>