245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0315 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0315  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  61.36 
 
 
223 aa  262  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  55.45 
 
 
220 aa  240  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0120  Methyltransferase type 12  51.82 
 
 
224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1655  methyltransferase type 12  44.55 
 
 
222 aa  185  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.159478  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.07 
 
 
231 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795739 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14181  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.11 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  37.89 
 
 
223 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  39.47 
 
 
226 aa  143  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07191  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.07 
 
 
227 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.0203679 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0094  SAM-dependent methyltransferase  34.07 
 
 
227 aa  141  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.333279  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0662  hypothetical protein  32.17 
 
 
231 aa  121  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07171  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.26 
 
 
231 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07151  methylase  29.69 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.353179  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07351  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.26 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.138217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.49 
 
 
220 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2907  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 
240 aa  79  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  29.95 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  27.88 
 
 
270 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 
283 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  27.49 
 
 
362 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  24.52 
 
 
411 aa  55.5  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  24.86 
 
 
263 aa  55.5  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  24.86 
 
 
263 aa  55.5  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  24.86 
 
 
263 aa  55.5  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
235 aa  55.1  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0353  methyltransferase type 12  35.35 
 
 
300 aa  55.1  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0874936 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.65 
 
 
269 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  26.16 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  35.44 
 
 
307 aa  53.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  34.15 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.93 
 
 
287 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.94 
 
 
250 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
355 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10526  RmtA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5VLE3]  25.87 
 
 
345 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.0936655 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
661 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  29.61 
 
 
310 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
309 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
363 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 
265 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.5 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.04 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  38.96 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.56 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  37.8 
 
 
274 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 
356 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  26.45 
 
 
653 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.78 
 
 
261 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  21.65 
 
 
580 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1418  Methyltransferase type 12  41.57 
 
 
328 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.09 
 
 
299 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  25.77 
 
 
230 aa  48.5  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 
300 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  23.66 
 
 
235 aa  48.5  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.83 
 
 
283 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.29 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  28.43 
 
 
240 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51802  predicted protein  24.8 
 
 
340 aa  47.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
286 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 
255 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  38.82 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.91 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
254 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  35.48 
 
 
300 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  34.21 
 
 
308 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.71 
 
 
265 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
254 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  27.1 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  35.48 
 
 
300 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
254 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  23.57 
 
 
250 aa  46.6  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.71 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  25.58 
 
 
261 aa  46.6  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  34.75 
 
 
307 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 
265 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  32.1 
 
 
187 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  26.74 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  28.05 
 
 
2867 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  26.44 
 
 
267 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  35 
 
 
227 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  32.93 
 
 
353 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.01 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.42 
 
 
299 aa  45.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 
270 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.9 
 
 
276 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
235 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  25.58 
 
 
268 aa  45.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0977  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.36 
 
 
245 aa  45.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.610826 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  29.59 
 
 
258 aa  45.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.24 
 
 
262 aa  45.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  37.18 
 
 
246 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  29.28 
 
 
210 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>