121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1609 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1609  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  100 
 
 
156 aa  314  4e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.682504  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0495  methyltransferase type 12  39.04 
 
 
273 aa  110  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1935  Methyltransferase type 11  39.73 
 
 
285 aa  98.2  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.38 
 
 
293 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.86 
 
 
289 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.86 
 
 
289 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  37.74 
 
 
311 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03520  protein arginine n-methyltransferase, putative  29.31 
 
 
342 aa  50.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0885983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 
295 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.67 
 
 
308 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 
295 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.48 
 
 
307 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174777  unclonable  0.000000000413669 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.78 
 
 
295 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
293 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.58 
 
 
293 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.58 
 
 
293 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.58 
 
 
293 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0391  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
293 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000998179  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 
293 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 
306 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 
293 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.78 
 
 
293 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.58 
 
 
293 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51802  predicted protein  27.83 
 
 
340 aa  47.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 
293 aa  48.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 
295 aa  48.1  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.58 
 
 
308 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 
293 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14081  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.81 
 
 
305 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0500355  normal  0.0701563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  29.76 
 
 
276 aa  47.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  26.35 
 
 
250 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10526  RmtA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5VLE3]  30.59 
 
 
345 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.0936655 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02290  arginine N-methyltransferase 3, putative  28.7 
 
 
596 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
295 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 
295 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.73 
 
 
293 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.56 
 
 
292 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
293 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.58 
 
 
295 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.78 
 
 
293 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.6 
 
 
312 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  25.5 
 
 
244 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.42 
 
 
294 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.29 
 
 
296 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.46 
 
 
321 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.53 
 
 
312 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.53 
 
 
312 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.53 
 
 
312 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.53 
 
 
312 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.53 
 
 
312 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
293 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1507  methyltransferase small  34.29 
 
 
207 aa  45.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.113673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.37 
 
 
312 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.53 
 
 
312 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.53 
 
 
312 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3376  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.43 
 
 
295 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.73 
 
 
293 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2244  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.17 
 
 
293 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.924831  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.53 
 
 
312 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0122  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
363 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678771  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  25 
 
 
242 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.42 
 
 
296 aa  44.3  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0556  ribosomal L11 methyltransferase  40.43 
 
 
289 aa  43.9  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00516263  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.29 
 
 
506 aa  44.3  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.48 
 
 
293 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  25 
 
 
242 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.48 
 
 
293 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.53 
 
 
312 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.78 
 
 
308 aa  43.9  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0925  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.75 
 
 
311 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3760  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.4 
 
 
306 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149604  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  24.83 
 
 
242 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3276  ribosomal protein L11 methyltransferase  38 
 
 
279 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17811  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.75 
 
 
311 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.578713  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35268  predicted protein  22.77 
 
 
394 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0796669  normal  0.0661795 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6261  NoeA host specific nodulation protein  44.19 
 
 
467 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161633 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0899  methyltransferase  28.18 
 
 
328 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17184  predicted protein  26.09 
 
 
445 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2376  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.22 
 
 
296 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03096  Protein methyltransferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5VK73]  50 
 
 
542 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.013321  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.75 
 
 
296 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2157  50S ribosomal protein L11 methyltransferase  40.98 
 
 
306 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3738  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
312 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  38.89 
 
 
264 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 
328 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
324 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  27.78 
 
 
258 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1050  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.65 
 
 
292 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00582001  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.67 
 
 
304 aa  42.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  36.21 
 
 
307 aa  42.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
309 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2309  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.67 
 
 
333 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000281824  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2427  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.78 
 
 
296 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.493009  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  38.89 
 
 
264 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  31.3 
 
 
249 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.95 
 
 
316 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.69 
 
 
290 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.25 
 
 
295 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 
314 aa  42  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1555  hypothetical protein  28.57 
 
 
228 aa  41.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>