More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0540 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 		 293 aa  603  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  64.85 
 
 		 292 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.95 
 
 		 293 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.61 
 
 		 293 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.95 
 
 		 293 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.61 
 
 		 293 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.61 
 
 		 293 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.61 
 
 		 293 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.61 
 
 		 293 aa  384  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.27 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.61 
 
 		 293 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.95 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  62.93 
 
 		 295 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  62.59 
 
 		 295 aa  377  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  62.93 
 
 		 311 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  61.9 
 
 		 295 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  61.02 
 
 		 295 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  60.34 
 
 		 295 aa  374  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03936  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.82 
 
 		 292 aa  375  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.165718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  61.22 
 
 		 295 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  60 
 
 		 294 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.05 
 
 		 306 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  61.9 
 
 		 293 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.05 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  62.24 
 
 		 293 aa  368  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.05 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  60.88 
 
 		 295 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  60.88 
 
 		 293 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.56 
 
 		 296 aa  366  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  60.2 
 
 		 293 aa  362  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.61 
 
 		 293 aa  359  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0391  ribosomal protein L11 methyltransferase  61.56 
 
 		 293 aa  354  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000998179  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3575  ribosomal protein L11 methyltransferase  64.97 
 
 		 293 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.12838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3574  ribosomal protein L11 methyltransferase  64.97 
 
 		 293 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00265065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3646  ribosomal protein L11 methyltransferase  64.97 
 
 		 293 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  decreased coverage  0.000138763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3681  ribosomal protein L11 methyltransferase  64.97 
 
 		 293 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.463059  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3743  ribosomal protein L11 methyltransferase  64.97 
 
 		 293 aa  352  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3697  ribosomal protein L11 methyltransferase  64.63 
 
 		 293 aa  351  8.999999999999999e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3554  ribosomal protein L11 methyltransferase  64.63 
 
 		 293 aa  348  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000257294  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03117  ribosomal protein L11 methyltransferase  64.63 
 
 		 293 aa  348  6e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.491501  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  64.63 
 
 		 293 aa  348  6e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106973  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3451  ribosomal protein L11 methyltransferase  64.63 
 
 		 293 aa  348  6e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000753069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3743  ribosomal protein L11 methyltransferase  64.63 
 
 		 293 aa  348  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4576  ribosomal protein L11 methyltransferase  64.63 
 
 		 293 aa  348  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000190936  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  64.63 
 
 		 293 aa  348  6e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0137973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3642  ribosomal protein L11 methyltransferase  64.63 
 
 		 293 aa  348  6e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000842217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03068  hypothetical protein  64.63 
 
 		 293 aa  348  6e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3224  ribosomal protein L11 methyltransferase  60.54 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  53.72 
 
 		 296 aa  330  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4818  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.04 
 
 		 292 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.983059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4693  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.04 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4871  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.38 
 
 		 292 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0712  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.38 
 
 		 292 aa  292  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4608  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.04 
 
 		 292 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4862  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.7 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5570  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.04 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64140  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.7 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.258424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0617  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.7 
 
 		 292 aa  289  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00809563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3446  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.85 
 
 		 298 aa  286  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.78 
 
 		 294 aa  287  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4402  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.02 
 
 		 292 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  50.17 
 
 		 299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06940  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.04 
 
 		 292 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1050  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.1 
 
 		 292 aa  277  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00582001  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1047  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.63 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.39 
 
 		 290 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.24 
 
 		 292 aa  255  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.97 
 
 		 307 aa  238  6.999999999999999e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174777  unclonable  0.000000000413669 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.98 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.31 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.62 
 
 		 295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.96 
 
 		 289 aa  227  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 		 289 aa  225  6e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0608  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.95 
 
 		 294 aa  225  8e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217984  hitchhiker  0.0000000198415 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.31 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.8 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.13 
 
 		 300 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.13 
 
 		 300 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.47 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.13 
 
 		 300 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.13 
 
 		 300 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.8 
 
 		 302 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.13 
 
 		 300 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.13 
 
 		 300 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.9 
 
 		 304 aa  218  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.26 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03000  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.72 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.8 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.87 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.28 
 
 		 296 aa  215  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.46 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.46 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.46 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.13 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.8 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.8 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.95 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.8 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1402  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.5 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000377664  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.52 
 
 		 506 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>