More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0556 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0556  ribosomal L11 methyltransferase  100 
 
 		 289 aa  567  1e-161  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00516263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.23 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.68 
 
 		 304 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.34 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.63 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.57 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.29 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.03 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  29.76 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.03 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.08 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  33.66 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4195  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.86 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.7 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.22 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.71 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.52 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.37 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.21 
 
 		 313 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.87 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.21 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.49 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.22 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.51 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  27.43 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.34 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.26 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  29.57 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.19 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3791  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.81 
 
 		 298 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.220237 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.99 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.05 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.05 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  28.05 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  32.86 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.86 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.05 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.64 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.31 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.71 
 
 		 290 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.86 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.5 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.39 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.11 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.05 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1671  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.63 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.216755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.17 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  31.58 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2309  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.21 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000281824  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  29.91 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.14 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.05 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1451  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.67 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.279923  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1500  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.15 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  29.33 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.97 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.85 
 
 		 319 aa  102  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3760  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.45 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149604  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.46 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.46 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.61 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0554  ribosomal L11 methyltransferase  28.77 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.46 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15141  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.53 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.41 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.14 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.14 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.14 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.38 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1586  ribosomal L11 methyltransferase  29.52 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.472869  normal  0.567959 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.11 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.45 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.72 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.55 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.83 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0925  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.94 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.34 
 
 		 287 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6514  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.37 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.104822 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1348  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.17 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.69 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2157  50S ribosomal protein L11 methyltransferase  26.05 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2455  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.47 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737706  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.29 
 
 		 289 aa  99.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.58 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.337848  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15391  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.28 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0920  ribosomal L11 methyltransferase  29.54 
 
 		 283 aa  99  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15541  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.23 
 
 		 303 aa  99  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.730327  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.41 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.62 
 
 		 327 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.41 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.61 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.59 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.81 
 
 		 321 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.92 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.6 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2376  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.9 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2427  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.44 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.493009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.78 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  31.53 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>