More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1260 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.337848  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1135  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.71 
 
 
281 aa  311  5.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.71 
 
 
281 aa  311  6.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.269015  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0604  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.64 
 
 
282 aa  308  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.36 
 
 
277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.55 
 
 
277 aa  270  1e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.09 
 
 
275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1348  ribosomal protein L11 methyltransferase  45 
 
 
275 aa  237  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1671  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.73 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.216755  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0488  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.19 
 
 
301 aa  219  6e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.83 
 
 
316 aa  136  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.55 
 
 
304 aa  135  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2309  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.93 
 
 
333 aa  135  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000281824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 
324 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.67 
 
 
309 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.2 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.86 
 
 
303 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.17 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.94 
 
 
315 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.22 
 
 
306 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.87 
 
 
306 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.8 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.54 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.57 
 
 
287 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  36.87 
 
 
264 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.12 
 
 
308 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  37.88 
 
 
264 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.57 
 
 
287 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.44 
 
 
313 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.44 
 
 
313 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.65 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.66 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.6 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.6 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.6 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.29 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.01 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.76 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.7 
 
 
295 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.53 
 
 
293 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.47 
 
 
321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.33 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 
294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1586  ribosomal L11 methyltransferase  27.55 
 
 
275 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.472869  normal  0.567959 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.18 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.29 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  34.76 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.78 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  32.71 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.41 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  25.76 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.41 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.84 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.84 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.69 
 
 
298 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.98 
 
 
313 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.51 
 
 
297 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.81 
 
 
293 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.49 
 
 
290 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.09 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.81 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.38 
 
 
289 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.7 
 
 
304 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.1 
 
 
293 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03936  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.48 
 
 
292 aa  112  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.165718  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.18 
 
 
292 aa  112  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.09 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.23 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.77 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  31.03 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.73 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.73 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.21 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.73 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.73 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  40.33 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  28.81 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.73 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.66 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.73 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1852  ribosomal L11 methyltransferase  35.34 
 
 
282 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.524439  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2156  ribosomal L11 methyltransferase  32.39 
 
 
296 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.4 
 
 
307 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.95 
 
 
289 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.24 
 
 
278 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.1 
 
 
293 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.74 
 
 
304 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.77 
 
 
298 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2003  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.17 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.221022  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1500  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.5 
 
 
299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.73 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.46 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.87 
 
 
298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.01 
 
 
312 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  34.3 
 
 
311 aa  109  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1101  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.95 
 
 
298 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0205003  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.3 
 
 
289 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.1 
 
 
319 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>