More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1998 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  100 
 
 
253 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1586  ribosomal L11 methyltransferase  65.07 
 
 
275 aa  346  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.472869  normal  0.567959 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0839  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.49 
 
 
279 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.149666 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.06 
 
 
307 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.97 
 
 
313 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.97 
 
 
313 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.02 
 
 
309 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  45.71 
 
 
287 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.97 
 
 
287 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.97 
 
 
287 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.92 
 
 
299 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  41.51 
 
 
299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.62 
 
 
299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.46 
 
 
286 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.88 
 
 
304 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  41.23 
 
 
286 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.75 
 
 
313 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.56 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.03 
 
 
316 aa  131  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  39.61 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.98 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  35.36 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2455  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.6 
 
 
302 aa  129  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737706  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.5 
 
 
283 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.54 
 
 
312 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.26 
 
 
327 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.41 
 
 
315 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.99 
 
 
315 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.91 
 
 
316 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  38.97 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.06 
 
 
312 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.06 
 
 
312 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.06 
 
 
312 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.06 
 
 
312 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.12 
 
 
318 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.91 
 
 
289 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0920  ribosomal L11 methyltransferase  39.02 
 
 
283 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.06 
 
 
312 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.06 
 
 
312 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.44 
 
 
290 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.2 
 
 
308 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.58 
 
 
312 aa  125  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.32 
 
 
312 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.58 
 
 
312 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.58 
 
 
312 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2055  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.41 
 
 
286 aa  122  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.56 
 
 
290 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.93 
 
 
321 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.78 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1671  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.58 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.216755  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.34 
 
 
305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1348  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.14 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.09 
 
 
306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.24 
 
 
312 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.89 
 
 
298 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.38 
 
 
315 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3080  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.66 
 
 
307 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.26 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.88 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.34 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.26 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  36.67 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.29 
 
 
277 aa  116  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.14 
 
 
277 aa  115  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.75 
 
 
298 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.77 
 
 
293 aa  115  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.48 
 
 
303 aa  115  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.9 
 
 
285 aa  115  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.76 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.337848  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.02 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.07 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.29 
 
 
297 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2309  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.76 
 
 
333 aa  113  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000281824  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1004  ribosomal L11 methyltransferase  35.43 
 
 
282 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2137  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.39 
 
 
337 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.47 
 
 
315 aa  113  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1135  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.82 
 
 
281 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.82 
 
 
304 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.19 
 
 
300 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.2 
 
 
292 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40 
 
 
295 aa  112  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.29 
 
 
295 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.79 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.52 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0089  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.65 
 
 
317 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.07 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0604  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.77 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.13 
 
 
317 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.64 
 
 
281 aa  111  9e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.269015  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1969  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.69 
 
 
317 aa  111  9e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.15 
 
 
293 aa  111  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  33.51 
 
 
264 aa  111  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  34.02 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.37 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  37.44 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.23 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.94 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.37 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.23 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.23 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>